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Melissa Constanza Alegría Arcos

Académico Asociado

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Computational biology, genomics, biological networks, structural bioinformatics, structure and function of protein, data science, drug design

Educación

  •  INGENIERO EN BIOINFORMATICA, UNIVERSIDAD DE TALCA. Chile, 2013
  •  LICENCIADO EN CIENCIAS DE LA BIOINFORMATICA, UNIVERSIDAD DE TALCA. Chile, 2013
  •  PhD en Ciencias mención Biofísica y Biología Computacional, UNIVERSIDAD DE VALPARAISO. Chile, 2021

Experiencia Académica

  •   Profesor ayudante Part Time

    UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

    Ciencias de la Vida

    Santiago, Chile

    2012 - 2014

  •   Profesor Part Time

    UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

    Ciencias de la Vida

    Santiago, Chile

    2013 - 2014

  •   Profesor Part Time

    UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

    Ciencias de la Vida

    Santiago, Chile

    2016 - 2016

  •   Estudiante de Doctorado Doctorado en Ciencias mención en Biofísica y Biología Computacional Other

    UNIVERSIDAD DE VALPARAISO

    Ciencias

    Valparaíso, Chile

    2015 - 2020

  •   Profesor Asociado Full Time

    UNIVERSIDAD DE LAS AMÉRICAS

    Facultad de Ingeniería y Negocios

    Santiago, Chile

    2021 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   Asistente de Investigación Full Time

    Universidad Andrés Bello

    Santiago, Chile

    2012 - 2015

  •   Ingeniero en Bioinformática / Estudiante de Doctorado Full Time

    uBiome SpA, Chile

    Santiago, Chile

    2017 - 2019

  •   Founder and CEO Part Time

    DrugDevs SpA

    Santiago, Chile

    2019 - A la fecha

  •   Reserach associate Part Time

    Universidad Autónoma

    Santiago, Chile

    2020 - 2021

  •   Acedémico Investigador Full Time

    Universidad de las Américas

    Santiago, Chile

    2021 - A la fecha

Premios y Distinciones

  •   BECA DE HONOR AL MERITO ACADEMICO

    UNIVERSIDAD DE TALCA

    Chile, 2010

    El Honor al Me?rito Acade?mico es el reconocimiento pu?blico que se hace al mejor estudiante de Pregrado de cada Escuela de la Universidad de Talca.

  •   Aplica tu Idea

    FUNDACION COPEC UNIVERSIDAD CATOLICA

    Chile, 2015

    Ganadora Segundo concurso de I+D aplicada para estudiantes de educacio?n Superior - "APLICA TU IDEA"

  •   Scholarship for Ph.D. studies

    UNIVERSIDAD DE VALPARAISO

    Chile, 2017

    Program for the Formation of Advanced Human Capital Program (PFCHA)

  •   Programa S Factory (TSF10)

    Corfo, Start-up Chile

    Chile, 2019

    Programa S Factory, generación 10 (TSF10). Proyecto "DRUGLAB" Código: 19TSF-112752


 

Article (15)

Unveiling Novel Urease Inhibitors for <i>Helicobacter pylori</i>: A Multi-Methodological Approach from Virtual Screening and ADME to Molecular Dynamics Simulations

Valenzuela-Hormazabal, Paulina; Sepulveda, Romina V.; Alegria-Arcos, Melissa; Valdes-Munoz, Elizabeth; Rojas-Perez, Victor; Gonzalez-Bonet, Ileana; Suardiaz, Reynier; Galarza, Christian; Morales, Natalia; Leddermann, Veronica; Castro, Ricardo I.; Benso, Bruna; Urra, Gabriela; Hernandez-Rodriguez, Erix W.; Bustos, Daniel

Article ISI
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES  (2024)

An experimental and theoretical exploration of the impact of co-solvent on the micellization behaviour of ionic surfactants

Fatma, Ishrat; Sharma, Vivek; Sharma, Praveen Kumar; Cantero-Lopez, Plinio; Assad, Humira; Sanchez, Julio; Alegria-Arcos, Melissa; Yanez, Osvaldo; Thakur, Ramesh Chand; Kumar, Ashish

Article ISI
CHEMICAL PHYSICS  (2023)

Calcium-Alginate-Chitosan Nanoparticle as a Potential Solution for Pesticide Removal, a Computational Approach

Yanez, Osvaldo; Alegria-Arcos, Melissa; Suardiaz, Reynier; Morales-Quintana, Luis; Castro, Ricardo I. I.; Palma-Olate, Jonathan; Galarza, Christian; Catagua-Gonzalez, Angel; Rojas-Perez, Victor; Urra, Gabriela; Hernandez-Rodriguez, Erix W. W.; Bustos, Daniel

Article ISI
POLYMERS  (2023)

Network pharmacology reveals multitarget mechanism of action of drugs to be repurposed for COVID-19

Alegria-Arcos, Melissa; Barbosa, Tabata; Sepulveda, Felipe; Combariza, German; Gonzalez, Janneth; Gil, Carmen; Martinez, Ana; Ramirez, David

Article ISI
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY  (2022)

Open protocols for docking and MD-based scoring of peptide substrates

Ochoa, Rodrigo; Santiago, Ángel; Alegría-Arcos, Melissa

Article SCOPUS
 (2022)

Unnexins: Homologs of innexin proteins in Trypanosomatidae parasites

Guiza, Juan; Garcia, Anibal; Arriagada, Javiera; Gutierrez, Camila; Gonzalez, Jorge; Marquez-Miranda, Valeria; Alegria-Arcos, Melissa; Duarte, Yorley; Rojas, Maximiliano; Gonzalez-Nilo, Fernando; Saez, Juan C.; Vega, Jose L.

Article ISI
JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY  (2022)

Application of ensemble pharmacophore-based virtual screening to the discovery of novel antimitotic tubulin inhibitors

Gallego-Yerga, Laura; Ochoa, Rodrigo; Lans, Isaias; Pena-Varas, Carlos; Alegria-Arcos, Melissa; Cossio, Pilar; Ramirez, David; Pelaez, Rafael

Article ISI
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL  (2021)

PSC-db: A Structured and Searchable 3D-Database for Plant Secondary Compounds

Valdes-Jimenez, Alejandro; Pena-Varas, Carlos; Borrego-Munoz, Paola; Arrue, Lily; Alegria-Arcos, Melissa; Nour-Eldin, Hussam; Dreyer, Ingo; Nunez-Vivanco, Gabriel; Ramirez, David

Article ISI
MOLECULES  (2021)

A physicochemical and conformational study of co-solvent effect on the molecular interactions between similarly charged protein surfactant (BSA-SDBS) system

Sharma V.; Yañez O.; Alegría-Arcos M.; Kumar A.; Thakur R.C.; Cantero-López P.

Article ISI SCOPUS
 (2020)

Analysis of theZonula occludensToxin Found in the Genome of the Chilean Non-toxigenicVibrio parahaemolyticusStrain PMC53.7

Perez-Reytor, Diliana; Pavon, Alequis; Lopez-Joven, Carmen; Ramirez-Araya, Sebastian; Pena-Varas, Carlos; Plaza, Nicolas; Alegria-Arcos, Melissa; Corsini, Gino; Jana, Victor; Pavez, Leonardo; del Pozo, Talia; Bastias, Roberto; Blondel, Carlos J.; Ramirez, David; Garcia, Katherine

Article ISI
FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY  (2020)

Experimental and theoretical structural/spectroscopical correlation of enterobactin and catecholamide

Moreno M.; Zacarias A.; Velasquez L.; Gonzalez G.; Alegría-Arcos M.; Gonzalez-Nilo F.; Gross E.K.U.

Article WOS-ESCI SCOPUS
Data in Brief  (2018)

IR and NMR spectroscopic correlation of enterobactin by DFT

Moreno, M.; Zacarias, A.; Porzel, A.; Velasquez, L.; Gonzalez, G.; Alegría-Arcos, M.; Gonzalez-Nilo, F.; Gross, E.K.U.

Article ISI SCOPUS
SPECTROCHIMICA ACTA PART A-MOLECULAR AND BIOMOLECULAR SPECTROSCOPY  (2018)

A Transient Receptor Potential Ion Channel in Chlamydomonas Shares Key Features with Sensory Transduction-Associated TRP Channels in Mammals

Arias-Darraz, L; Cabezas, D.; Colenso C.K.; Alegria-Arcos M.; Bravo-Moraga, F; Varas-Concha, I; Almonacid D.E.; Madrid R.; Brauchi, S.

Article ISI SCOPUS
PLANT CELL  (2015)

Participation of the Salmonella OmpD Porin in the Infection of RAW264.7 Macrophages and BALB/c Mice

IPINZA, F.; Collao B; Monsalva D.; Bustamante V.H.; Luraschi, R.; Alegria-Arcos M.; Almonacid D.E.; Aguayo, D; Calderon I.L.; Gil, F; Santiviago, C. A.; Morales E.H; Calva E.; Saavedra, C. P.

Article ISI SCOPUS
PLOS ONE  (2014)

Penicillium purpurogenum produces two GH family 43 enzymes with beta-xylosidase activity, one monofunctional and the other bifunctional: Biochemical and structural analyses explain the difference

Ravanal, MC.; Alegria-Arcos M.; Gonzalez-Nilo, FD; Eyzaguirre, J

Article ISI SCOPUS
Archives of Biochemistry and Biophysics  (2013)

Abstract (1)

In Silico Characterization of Double Knot Toxin Binding to TRPV1 Channel

Sepulveda, R; Alegria-Arcos, M; Diaz-Franulic, I; Gonzalez-Nilo, FD

Abstract ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2016)

Patent (2)

RIESKE-TYPE OXYGENASE/REDUCTASE TARGETED DRUGS FOR DIAGNOSTIC AND TREATMENT OF DISEASES

Apte, Zachary S.; Richman, Jessica; Almonacid, Daniel; Marquez, Valeria; Araya, Ingrid; Alegria, Melissa; Saavedra, Mario; Gomez, Luis; Espinoza, Janyra; Gimpel, Javier; Morales, Eduardo.; Ortiz, Rodrigo

Patent United States Patent Application
 

THERAPEUTIC & DIAGNOSTICS COMPOSITIONS TARGETING TOLL-LIKE RECEPTORS AND METHODS THEREOF

Apte, Zachary S.; Richman, Jessica; Almonacid, Daniel E.; Alegria, Melissa; Marquez, Valeria; Morales, Eduardo.; Ortiz, Rodrigo; Torres, Janet; Covarrubias, Paulo; Gimpel, Javier; Araya, Ingrid

Patent United States Patent Application
 

Proyecto (5)

CARACTERIZACIÓN DEL EFECTO ESTRUCTURAL DE MUTACIONES DESCUBIERTAS EN EXOMAS TUMORALES MEDIANTE DETERMINACIÓN DE ESTABILIDAD PROTEICA CONSIDERANDO LA DIVERSIDAD CONFORMACIONAL EN FAMILIAS DE PROTEÍNAS

FONDEF (3150671)

Proyecto
2015-2017
Personal técnico y/o de apoyo

Centro Interdisciplinario de Neurociencia de Valparaiso (CINV).

Iniciativa Cientiifica Milenio, Ministerio de Economia (P09-022-F)

Proyecto
2015-2016
Personal técnico y/o de apoyo

Aplicación de indicadores bibliométricos para la selección de manuscritos en revistas nacionales ISI=> su efecto sobre el factor de impacto.

FONDEF (1130918)

Proyecto
2013-2015
Personal técnico y/o de apoyo

ASSESSING THE MOLECULAR AND BIOLOGICAL IMPACT OF CANCER MUTATIONS IN ENZYME SUPERFAMILIES USING PROTEIN AND CHEMICAL SIMILARITY NETWORKS.

FONDECYT (11130578)

Proyecto
2013-2016
Personal técnico y/o de apoyo

STUDY OF STRUCTURAL AND DYNAMIC PROPERTIES THAT GOVERN SELECTIVITY AND CONDUCTANCE OF K CHANNELS UNDER NON-EQUILIBRIUM CONDITIONS.

FONDECYT (1131003)

Proyecto
2013-2015
Personal técnico y/o de apoyo

Review (1)

A journey from molecule to physiology and <i>in silico</i> tools for drug discovery targeting the transient receptor potential vanilloid type 1 (TRPV1) channel

Amaya-Rodriguez, Cesar A.; Carvajal-Zamorano, Karina; Bustos, Daniel; Alegria-Arcos, Melissa; Castillo, Karen

Review ISI
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY  (2024)

19
Melissa Alegría

Académico Asociado

Facultad de Ingeniería y Negocios

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

4
Fernando Gonzalez

Titular Professor

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andres Bello

Santiago, Chile

4
David Ramirez

Profesor Asistente

Facultad de Ciencias Biológicas

Universidad de Concepción

Concepcion, Chile

3
Daniel Bustos

Auxiliar Professor

Vicerrectoría de Investigación y Postgrado

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

3
osvaldo yañez

Académico Investigador

Facultad de Ingeniería y Negocios

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

2
Luis Velasquez

Director and Full Professor

Medicine

Universidad SEK

Santiago, Chile

2
Mabel Moreno

Profesor

Universidad SEK

Santiago, Chile

1
Ingo Dreyer

Professor Titular

Bioinformatica

Universidad de Talca

Talca, Chile

1
Gino Corsini

Director Instituto Ciencias Biomédicas

Instituto de Ciencias Biomédicas

Universidad Autónoma de Chile

Santiago, Chile

1
MARIA CARMEN LOPEZ

Assistant professor

UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Valdivia, Chile

1
Diliana Pérez

Docente con grado de doctor

Universidad Autónoma de Chile

Santiago, Chile

1
Carlos Blondel

Profesor Asistente

Instituto de Ciencias Biomédicas

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Roberto Bastías

Profesor

Facultad de Ciencias

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

1
Leonardo Pavez

Profesor Asociado

Instituto de Ciencias Naturales

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

1
Talia del Pozo

Académico Investigador

FAVA

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

1
Gabriel Nuñez

Jefe de Carrera, Ingeniería Civil Informática

Ciencias Naturales y Tecnología

Universidad de Aysén

Coyhaique, Chile

1
Nicolás Plaza

Profesor

Ciencias de la Salud

Universidad Autónoma de Chile

Santiago, Chile

1
Plinio Cantero

Profesor Adjunto

Química

Universidad Andrés Bello

Santiago de Chile, Chile

1
Roberto Luraschi

Asistente de investigación

Departamento de biología

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

1
Juan Saez

Professor

Instituto de Neurociencias

Universidad de Valparaiso

Valparaíso, Chile

1
Luis Morales

Profesor Asociado

Intituto de Ciencias Biomédicas

Universidad Autónoma de Chile

Talca, Chile

1
IVAN CALDERON

Associate Professor / Principal Investigator/ Master in Biotechnology & Life Sciences Director

Biological Sciences

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

SANTIAGO, Chile

1
Fernando Gil

Associate Professor

Biological Sciences

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

1
EDUARDO HUGO MORALES SIERRA 

1
Claudia Saavedra

Full Professor

Departmento de Ciencias de la Vida

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

Santiago, Chile

1
Daniel Aguayo

Associate Professor

ITISB

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Viña del Mar, Chile

1
Sebastian Brauchi

Associate Professor

Physiology

Universidad Austral de Chile

Valdivia, Chile

1
Rodolfo Madrid

Full Professor

Departamento de Biología

UNIVERSIDAD DE SANTIGO DE CHILE

Santiago, Chile

1
Bruna Benso

Profesora Asistente

Facultad de Medicina

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile