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Ruben Esteban Avendaño Herrera

Full Professor

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

Viña del Mar, Chile

Pathology in Aquaculture, diseases of aquatic organisms, biotehnolocigal tools applied to aquaculture and biotechnology, standardization of procedures to control and validate the appropriate use of antibotics,development of vaccines against aquatic .

Aquaculture engineer, UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA. Chile, 1997
Bachelor Marine science, UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA. Chile, 1997
PhD Biology, Universidad de Santiago de Compostela. España, 2005
Master Diploma de Estudios Avanzados, UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA. España, 2004
Post Graduado Biología, UNIVERSIDAD ANDRES BELLO. Chile, 2012

Full Professor Full Time

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Ciencias de la Vida

Viña del Mar, Chile

2016 - A la fecha
Associate Professor Full Time

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Ciencias de la Vida

Viña del Mar, Chile

2010 - 2016

Main Researcher in Fish Pathology Laboratory Full Time

Veterquimica S.A.

Santiago, Chile

2006 - 2009
Microscopy expert Part Time

Universidad de Antofagasta

Antofagasta, Chile

1998 - 2001
Team member, participation and grant elaboration MECESUP Part Time

Universidad de Antofagasta

Antofagasta, Chile

1999 - 2001
Responsible, training team in the Microsoft Program Part Time

Universidad de Antofagasta

Antofagasta, Chile

2000 - 2000
In charge of environmental impact study, Antofagasta port(SILOB-CHILE) Full Time

Universidad de Antofasta

Antofagasta, Chile

1997 - 1997

Estudiantes de magister (tutoría y co-tutoria):

2018. Jennie Castro Maruri (Magister en Ciencias). Título tesis: "Caracterización bioquímica y molecular de Streptococcus dysgalactiae, descripción patológica de la enfermedad septicémica emergente que provoca en la trucha arcoíris". Universidad Autónoma de México, México.

2018. Johan Quezada Olguín (Magister en Biotecnología). Título tesis: "Caracterización antigénica de aislados de Renibacterium salmoninarum y su rol sobre la patogenicidad en condiciones in vitro". Universidad Andres Bello, Chile.

2018. Jessica Castrejón-Nájera (Magister en Ciencias Agrícolas y Recursos Naturales). Título tesis: "Complejo septicémico en trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) generado por la bacteria acido láctica Weissella sp.". Universidad Autónoma de México, México.

2017. Alma Yanine Castillo Miranda (Magister en Ciencias Agrícolas y Recursos Naturales). Título tesis: "Identificación y caracterización de bacterias filamentosas asociadas al síndrome del alevín de la trucha arcoíris (RTFS)". Universidad Autónoma de México, México.

2016. Lady Diana Castro Ramírez (Magíster en Ciencia). Título tesis: "Análisis de resistencia antibiótica y genes involucrados, mediante el uso de polimorfismos de nucleótidos simple (SNPs) en cepas de Piscirickettsia salmonis aisladas en Chile". Universidad Austral de Chile, Chile.

2016. Juan Guzmán Castillo (Magister en Ciencia Animal). Título tesis: "Eficacia del tratamiento de florfenicol y oxitetraciclina en trucha arcoiris (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) infectadas con aislados de Flavobacterium psychrophilum silvestres y no silvestres". Universidad Austral de Chile, Chile.

2015: Paulina Ahumada Morales (Magister en Acuicultura). Título tesis: "Desarrollo de una vacuna para la prevención de la enfermedad causada por Flavobacterium psychrophilum en trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss)". Universidad Andres Bello, Chile.

2015. Jacqueline del Pilar Chavez Mardones (Magister en Bioquímica y bioinformatica): Título tesis: "Secuenciación masiva de transcriptoma del piojo de mar Caligus rogercresseuyi expuestos a antiparásitos utilizados en la acuicultura". Universidad de Concepción, Chile.

2014. Loreto Ramirez Munizaga (Magister en Ing. Acuicultura). Título tesis: "Estandarización de un modelo de infección con Flavobacterium psychrophilum en alevines de trucha arcoiris". Universidad Andrés Bello, Chile.

2014. Oscar Evrard Arrué (Magister en Biotecnologia). Título tesis: “Análisis proteíco del patógeno acuícola Flavobacterium psychrophilum cultivado en condiciones restrictivas de hierro". Universidad Andrés Bello, Chile.

2013. Soraya Salazar Aguilera (Magister en Biotecnología). Titulo tesis: “Estudio comparativo in vitro de la respuesta inmune innata de salmón del Atlántico y trucha arcoíris, frente al patógeno Streptococcus phocae”. Universidad Andrés Bello, Chile.

2012. Hernán Henríquez-Núñez (Magister en Acuicultura). Título tesis: “Estudio de la susceptibilidad a antimicrobianos de cepas chilenas de Flavobacterium psychrophilum y Vibrio ordalii aisladas de salmónidos cultivados”. Universidad Andrés Bello, Chile.

2011. Sebastian Lagos Donoso (Magíster en Acuicultura). Título tesis: “Estudio de la adición de pigmentos carotenoides en la pigmentación de la piel y parámetros productivos de ejemplares de Cabrilla Sebastes oculatus, mantenidos en cautiverio”. Universidad Andrés Bello, Chile.

2010. Alberto González Contreras (Magister en Acuicultura) Título tesis: “Estudio de las propiedades de superficie asociadas a la virulencia en el patógeno de salmón del Atlántico (Salmo salar) cultivado en Chile, Streptococcus phocae”. Universidad Andrés Bello, Chile.

2008. Jessica Abad Hernández (Magister en Acuicultura). Título tesis: “Evaluación de la eficacia del producto Plasmicel sobre el patógeno de salmón del Atlántico (Salmo salar) Flavobacterium psychrophilum”. Universidad Andrés Bello, Chile.

2008. Pedro Ilardi Lazcano (Magister en Acuicultura). Título tesis: “Identificación, caracterización y patogenicidad de bacterias de la familia Flavobacteriaceae patógenos oportunistas en el cultivo de salmónidos”. Universidad Andrés Bello, Chile.

Profesor Honorario, Universidad Nacional de Tumbes, Perú. Resolución No. 0417-2013/UNIT-CU.

Universidad Nacional de Tumbes

Peru, 2013

Profesor Honorario
Director del Grupo de Estudio (GE) de Salud y Producción Animal de FONDECYT.

COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

Chile, 2012

Director Salud y Producción Animal
Secretario Sociedad Chilena de Acuicultura

Sociedad Chilena de Acuicultura

Chile, 2012

Secretario
Advisor Working Group on Aquatic Animals and Clinical and Laboratory Standard Institute (CLSI).

Clinical Laboratory Standard Institute

Estados Unidos, 2011

Advisor
Miembro del Comité de Experto del Servicio Nacional de Pesca para Piscirickettsia salmonis.

SERVICIO NACIONAL DE PESCA

Chile, 2011

Miembro del Comité
Premio Extraordinario de Doctorado, Universidad de Santiago de Compostela. Reconocimiento a la mejor tesis de doctorado de la Facultad de Biología año 2006.

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA

España, 2007

Mejor Tesis de la Universidad Santiago de Compostela en Biología 2006
Primer lugar en la promoción de estudiante de la carrera de Ingeniería de Acuicultura de la Universidad de Antofagasta.

UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA

Chile, 2000

Primer lugar promoción estudiantes Ing. en Acuicultura.
Beca "Apoyo a la participación de estudiantes de doctorado en congresos nacionales y sociedades cientificas"

COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

Chile, 2003

Beca para asistir al XXV Congreso Chileno de Microbiología "Dr. Juan Noé Crevani (1877-1947), Antofagasta, Chile. (Me permitió viajar desde España donde realizaba mis PhD y participar en el congreso presentando avances en mi tesis de doctorado)
Beca

Xunta de Galicia

España, 2003

Beca otorgada por la "Xunta de Galicia" (España) para asistir y presentar avances de tesis de doctorado en la II EAFP International Conference on Diseases of Fish and Shellfish, realizada en St. Julians, Malta
Beca Sociedad Española de Microbiologia

Sociedad Española de Microbiologia (SEM)

Chile, 2004

Beca otorgada por al Sociedad Española de Microbiología (SEM), como ayuda a estudiante para participaren a la V Reunión del Grupo de Microbiología del Medio Acuático de la SEM, la cual se realizó en Tarragona, España
Beca: Oficina de Investigación y Tecnología, Universidad de Santiago de Compostela

Oficinade Investigación y Tecnología de la Universidad de Santiago de Compostela

Chile, 2005

Beca otorgada durante los estudios de doctorado (España) para participar en el XI Congreso Latinoamericano de Ciencias del Mar y XXV Congreso de Ciencias del Mar de Chile, realizado en Viña del Mar.
Beca CONICYT-BID

CONICYT-BID

Chile, 2002

Beca otorgada por CONCYT-BID para realización de mis estudios PhD (2002-2006) en la Universidad de Santiago de Compostela (España)
Miembro del consejo editorial da Journal of Fish Diseases

Journal of Fish Diseases

Chile, 2019

Miembro del consejo editorial do Journal of Fish Diseases. Acepté la invitacion en 2019 y sigue vigente. (Member of the editorial board of Journal of Fish Diseases. Accepted the invitation in 2019 and to date, still member.)
Portada Bulletin of the European Association of Fish Pathologists

Bulletin of the European Association of Fish Pathologists

Reino Unido, 2020

Portada del Bulletin of the Eurpean Association of Fish Pathologists, no. 40, volumen 5, paginas 199-211. Portada presenta foto de un estudio: Isolation and characterization of lytic bacteriophages against atypical Aeromonas salmonicida spp. isolated from farmed fish in Chile. Autores: Poblete-Morales M, Irgang R, Tapia-Cammas D, Avendaño-Herrera R
Portada de Journal of Fish Diseases

Journal of Fish Diseases

Chile, 2019

Portada de Journal of Fish Diseases, Volumen 42, numero 4, paginas 617-621. Imagen asociada al estudio: A high-throughput analysis of biofilm formation by the fish pathogen Tenacibaculum maritimum. Autores: Levipán HA, Irgang R, Tapia-Cammas D, Avendaño-Herrera R
Reconocimiento como mejor investigador del año

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Chile, 2021

Premio a mejor investigador del año en el área de Agricultura e Ciencias Biológicas de Universidad Andres Bello.
Reconocimiento como mejor investigador del año

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Chile, 2020

Mejor investigador del año 2020 en el área de Ciencias Veterinarias de la Universidad Andres Bello.
Reconocimiento como mejor investigador del año

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Chile, 2018

Reconocimiento como mejor investigador del año de Universidad Andres Bello.
Miembro Comité becas CONICYT - Ciencias Veterinarias

COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

Chile, 2017

Desde el año 2017 (a la fecha), miembro del comité de becas en el área de Ciencias Veterinarias de CONICYT
Miembro INN

INSTITUTO NACIONAL DE NORMALIZACION

Chile, 2018

Desde 2018 (a la fecha): Miembro del INN (Instituto Nacional de Normalización), Comité Pesca y Acuicultura
Miembro comité CCTA

SUBPESCA - CCTA

Chile, 2021

Desde febrero 2021 (duración 4 años): Miembro del Comité Científico en Acuicultura en el área sanitaria SUBPESCA (Subsecretaria de Pesca y Acuicultura)
Evaluador CORFO

CORPORACION DE FOMENTO DE LA PRODUCCION

Chile, 2016

Desde 2016 (a la fecha): Evaluador para CORFO, para evaluación de proyectos INNOVAChile-CORFO. Evaluación de contratos tecnológicos y proyectos.
Miembro comité de Formación de Personal Avanzado - CONICYT

COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

Chile, 2017

Desde 2017 (a la fecha): Miembro del comité del programa CONICYT para formación de capital humano avanzado, (Ministerio de Educación, CONICYT)
Acreditador CNA

COMISIÓN NACIONAL DE ACREDITACIÓN

Chile, 2017

Durante el año 2017, acreditador de CNA en la Universidad de la Frontera (Temuco). Se evaluó el curso de doctorado en ciencias, molecular y aplicada. Evaluación y visita realizada el 13 de Octubre de 2017.
Miembro Comité de Pesca y Acuicultura de FONDEF

FONDEF

Chile, 2016

Desde el 2016 (a la fecha): Miembro del Comité de Pesca y Acuicultura de FONDEF
Miembro de GE - FONDECYT

COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

Chile, 2016

Desde 2016 (a la fecha): Miembro del Grupo de Estudio (GE), evaluador de proyectos en el área de Salud y Producción Animal (FONDECYT)
Miembro Comision doctorado e Biotecnología

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Chile, 2012

Desde 2012 (a la fecha): Miembro de la comisión de doctorado en Biotecnología de la Universidad Andres Bello.


Co-existence of two Yersinia ruckeri biotypes and serotype O1a retrieved from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) farmed in Puno, Peru Fernandez-Espinel, Carla; Medina-Morillo, Marco; Irgang, Rute; Sotil, Giovanna; Araya-Leon, Henry; Flores-Dominick, Violeta; Romalde, Jesus L.; Avendano-Herrera, Ruben; Yunis-Aguinaga, Jefferson Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2023)
Comparative polyphasic characterization of Weissella strains isolated from beaked whale and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss): confirmation of Weissella ceti sp. nov. and description of the novel Weissella tructae sp. nov. isolated from farmed rainbow trout (vol 53, pg 2263, 2022) Pereira, Felipe Luiz; Dorella, Fernanda Alves; Castrejon-Najera, Jesica; Reis, Francisco Yan Tavares; Ortega, Cesar; Irgang, Rute; Echeverria-Bugueno, Macarena; Avendano-Herrera, Ruben; Figueiredo, Henrique Cesar Pereira Article ISI BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY (2023)
Development of a PCR assay for the specific identification of the fish pathogen Tenacibaculum piscium Saldarriaga-Cordoba, Monica; Araya-Leon, Henry; Irgang, Rute; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2023)
Draft Genome Sequence of Tenacibaculum haliotis Strain RA3-2(T), Isolated from Korean Wild Abalone (Haliotis discus hannai) Avendano-Herrera, Ruben; Saldarriaga-Cordoba, Monica; Araya-Leon, Henry; Irgang, Rute Article ISI MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS (2023)
Flavobacterium pygoscelis sp. nov., isolated from a chinstrap penguin chick (Pygoscelis antarcticus) Irgang, Rute; Poblete-Morales, Matias; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2023)
Healthy and infected Atlantic salmon (Salmo salar) skin-mucus response to Tenacibaculum dicentrarchi under in vitro conditions Echeverria-Bugueno, Macarena; Irgang, Rute; Mancilla-Schulz, Jorge; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY (2023)
In vitro phenotypic evidence for the utilization of iron from different sources and siderophores production in the fish pathogen Tenacibaculum dicentrarchi Avendano-Herrera, Ruben; Saldarriaga-Cordoba, Monica; Echeverria-Bugueno, Macarena; Irgang, Rute Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2023)
Method for lineage typing of epidemic Renibacterium salmoninarum in Chilean salmon farms Mora-Salas, Patricia; Zapararte, Sebastian; Villouta, Pamela; Araya-Leon, Henry; Avendano-Herrera, Ruben; Melo, Francisco; Mardones, Fernando O. Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2023)
Tenacibaculosis caused by Tenacibaculum maritimum: Updated knowledge of this marine bacterial fish pathogen Mabrok, Mahmoud; Algammal, Abdelazeem M. M.; Sivaramasamy, Elayaraja; Hetta, Helal F. F.; Atwah, Banan; Alghamdi, Saad; Fawzy, Aml; Avendano-Herrera, Ruben; Rodkhum, Channarong Article ISI FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY (2023)
Collective behavior and virulence arsenal of the fish pathogen Piscirickettsia salmonis in the biofilm realm Levipan, Hector A.; Irgang, Rute; Felipe Opazo, L.; Araya-Leon, Henry; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY (2022)
Commentary: Piscirickettsia salmonis Produces a N-Acetyl-L-Homoserine Lactone as a Bacterial Quorum Sensing System-Related Molecule Levipan, Hector A.; Reyes-Garcia, Luis; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY (2022)
Comparative pan-genomic analysis of 51 Renibacterium salmoninarum indicates heterogeneity in the principal virulence factor, the 57 kDa protein Saldarriaga-Cordoba, Monica; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2022)
Comparative polyphasic characterization of Weissella strains isolated from beaked whale and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss): confirmation of Weissella ceti sp. nov. and description of the novel Weissella tructae sp. nov. isolated from farmed rainbow trout Pereira, Felipe Luiz; Dorella, Fernanda Alves; Castrejon-Najera, Jesica; Tavares Reis, Francisco Yan; Ortega, Cesar; Irgang, Rute; Echeverria-Bugueno, Macarena; Avendano-Herrera, Ruben; Pereira Figueiredo, Henrique Cesar Article ISI BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY (2022)
Development of a quantitative polymerase chain reaction assay for detection of the aetiological agents of piscine lactococcosis Shahin, Khalid; Mukkatira, Kaveramma; Yazdi, Zeinab; Richey, Christine; Kwak, Kevin; Heckman, Taylor, I; Mohammed, Haitham H.; Ortega, Cesar; Avendano-Herrera, Ruben; Keleher, Bill; Hyatt, Michael W.; Drennan, John D.; Adkison, Mark; Griffin, Matt J.; Soto, Esteban Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2022)
Draft Genome Sequence of Tenacibaculum ovolyticum To-7Br, Recovered from a Farmed Atlantic Salmon (Salmo salar) Avendano-Herrera, Ruben; Saldarriaga-Cordoba, Monica; Irgang, Rute Article ISI MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS (2022)
Evaluation of the in vitro susceptibility of Tenacibaculum dicentrarchi to tiamulin using minimum inhibitory concentration tests Irgang, Rute; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2022)
Isolation, identification, virulence potential and genomic features of Tenacibaculum piscium isolates recovered from Chilean salmonids Avendano-Herrera, Ruben; Olsen, Anne Berit; Saldarriaga-Cordoba, Monica; Colquhoun, Duncan J.; Reyes, Victor; Rivera-Bohle, Javier; Duchaud, Eric; Irgang, Rute Article ISI Transboundary and Emerging Diseases (2022)
Nanopore sequencing evidenced the presence of fish bacterial pathogens in the sea louse (Caligus rogercresseyi) microbiota collected from distant salmon farms in Chile Morales-Rivera, Maria F.; Valenzuela-Miranda, Diego; Valenzuela-Munoz, Valentina; Nunez-Acuna, Gustavo; Avendano-Herrera, Ruben; Gallardo-Escarate, Cristian Article ISI AQUACULTURE (2022)
Use of antimicrobials in Chilean Salmon farming: Facts, myths and perspectives Avendano-Herrera, Ruben; Mancilla, Marcos; Miranda, Claudio D. Article ISI REVIEWS IN AQUACULTURE (2022)
Assessing the impacts of skin mucus fromSalmo salarandOncorhynchus mykisson the growth and in vitro infectivity of the fish pathogenPiscirickettsia salmonis Levipan, Hector A.; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
Comparison between genome sequences of Chilean Tenacibaculum dicentrarchi isolated from red conger eel (Genypterus chilensis) and Atlantic salmon (Salmo salar) focusing on bacterial virulence determinants Saldarriaga-Cordoba, Monica; Irgang, Rute; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
Evidence for the existence of extracellular vesicles in Renibacterium salmoninarum and related cytotoxic effects on SHK-1 cells Echeverria-Bugueno, Macarena; Balada, Cristobal; Irgang, Rute; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
Experimental tenacibaculosis infection in adult conger eel (Genypterus chilensis, Guichenot 1948) by immersion challenge withTenacibaculum dicentrarchi Irgang, Rute; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
First report and characterization of Tenacibaculum maritimum isolates recovered from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) farmed in Chile Valdes, Sara; Irgang, Rute; Barros, Maria C.; Ilardi, Pedro; Saldarriaga-Cordoba, Monica; Rivera-Bohle, Javier; Madrid, Enrique; Gajardo-Cordova, Johana; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
Florfenicol and oxytetracycline susceptibility patterns in Chilean isolates of Tenacibaculum dicentrarchi: An emerging pathogen for farmed salmonids Irgang, Rute; Mancilla, Marcos; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
Odontogenic hamartomas in cultured angelfish (Pterophyllum scalare) Fajardo, Raul; Avendano-Herrera, Ruben; Valladares-Carranza, Benjamin; Guzman, Ernesto; Ortega, Cesar Article ISI JOURNAL OF EXOTIC PET MEDICINE (2021)
Piscirickettsia salmonis does not evidence quorum sensing based on acyl-homoserine lactones Levipan, Hector A.; Reyes-Garcia, Luis; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
Protein-Based Vaccine Protect Against Piscirickettsia salmonis in Atlantic Salmon (Salmo salar) Pontigo, Juan Pablo; Espinoza, Carla; Hernandez, Mauricio; Nourdin, Guillermo; Oliver, Cristian; Avendano-Herrera, Ruben; Figueroa, Jaime; Rauch, Cecilia; Troncoso, Jose M.; Vargas-Chacoff, Luis; Yanez, Alejandro J. Article ISI FRONTIERS IN IMMUNOLOGY (2021)
Proteomic analysis reveals Renibacterium salmoninarum grown under iron-limited conditions induces iron uptake mechanisms and overproduction of the 57-kDa protein Avendano-Herrera, Ruben; Saldivia, Pablo; Bethke, Jorn; Vargas, Cristian; Hernandez, Mauricio Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2021)
Salmon aquaculture, Piscirickettsia salmonis virulence, and one health: Dealing with harmful synergies between heavy antimicrobial use and piscine and human health comment on Avendaño-Herrera, Ruben Article AQUACULTURE (2021)
Arthrobacter ulcerisalmonis sp. nov., isolated from an ulcer of a farmed Atlantic salmon (Salmo salar), and emended description of the genus Arthrobacter sensu lato Kämpfer, Peter; Busse, Hans-Jürgen; Schumann, Peter; Criscuolo, Alexis; Clermont, Dominique; Irgang, Rute; Poblete-Morales, Matías; Glaeser, Stefanie P.; Avendaño-Herrera, Ruben Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2020)
Effects of crowding on the three main proteolytic mechanisms of skeletal muscle in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Valenzuela CA; Ponce C.; Zuloaga, R.; Gonzalez, P.; Avendaño-Herrera R; Valdés JA; Molina, A. Article VETERINARY RESEARCH (2020)
First Identification and Characterization ofLactococcus garvieaeIsolated from Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) Cultured in Mexico Ortega, Cesar; Irgang, Rute; Valladares-Carranza, Benjamin; Collarte, Constanza; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI Animals (2020)
Flavobacterium salmonis sp. nov. isolated from Atlantic salmon (Salmo salar) and formal proposal to reclassify Flavobacterium spartansii as a later heterotypic synonym of Flavobacterium tructae Kampfer P; Irgang R; Glaeser SP; Busse HJ; Criscuolo A; Clermont D; Avendaño-Herrera R Article INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2020)
Identification and characterization of outer membrane vesicles from the fish pathogen Vibrio ordalii Echeverria-Bugueno, Macarena; Espinosa-Lemunao, Rodrigo; Irgang, Rute; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2020)
Improved understanding of biofilm development by Piscirickettsia salmonis reveals potential risks for the persistence and dissemination of piscirickettsiosis Levipan, Hector A.; Irgang, Rute; Yanez, Alejandro; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI SCIENTIFIC REPORTS (2020)
Isolation and characterization of lytic bacteriophages against atypical Aeromonas salmonicida spp. isolated from fish farmed in Chile Poblete-Morales, M; Irgang, R; Tapia-Cammas, D; Avendano-Herrera, R Article BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2020)
Legacy and novel flame retardants from indoor dust in Antarctica: Sources and human exposure Corsolini, Simonetta; Metzdorff, América; Baroni, Davide; Roscales, Jose L.; Jiménez, Begoña; Cerro-Gálvez, Elena; Dachs, Jordi; Galbán-Malagón, Cristóbal; Audy, Ond?ej; Kohoutek, Ji?í; P?ibylova, Petra; Poblete-Morales, Matias; Avendaño-Herrera, Ruben; Bergami, Elisa; Pozo, Karla Article Environmental Research (2020)
Microbial Communities Associated with Farmed Genypterus chilensis: Detection in Water Prior to Bacterial Outbreaks Using Culturing and High-Throughput Sequencing Levican, Arturo; Fisher, Jenny C.; McLellan, Sandra L.; Avendaño-Herrera, Ruben Article Animals (2020)
New salmonid hosts forTenacibaculumspecies: Expansion of tenacibaculosis in Chilean aquaculture Avendano-Herrera, Ruben; Collarte, Constanza; Saldarriaga-Cordoba, Monica; Irgang, Rute Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2020)
Proposed protocol for performing MIC testing to determine the antimicrobial susceptibility ofRenibacterium salmoninarumin Chilean salmon farms Grandon, Maritza; Irgang, Rute; Saavedra, Jose; Mancilla, Marcos; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2020)
Psychrobacter pygoscelis sp. nov. isolated from the penguin Pygoscelis papua Kämpfer, Peter; Glaeser, Stefanie P.; Irgang, Rute; Fernández-Negrete, Guillermo; Poblete-Morales, Matías; Fuentes-Messina, Derie; Cortez-San Martín, Marcelo; Avendaño-Herrera, Ruben Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2020)
Serological diversity inFlavobacterium psychrophilum: A critical update using isolates retrieved from Chilean salmon farms Avendano-Herrera, Ruben; Tapia-Cammas, Diana; Duchaud, Eric; Irgang, Rute Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2020)
Subcellular Location of Piscirickettsia salmonis Heat Shock Protein 60 (Hsp60) Chaperone by Using Immunogold Labeling and Proteomic Analysis Oliver, Cristian; Sánchez, Patricio; Valenzuela, Karla; Hernández, Mauricio; Pontigo, Juan Pablo; Rauch, Maria C.; Garduño, Rafael A.; Avendaño-Herrera, Ruben; Yáñez, Alejandro J. Article ISI SCOPUS MICROORGANISMS (2020)
Tenacibaculum piscium sp. nov., isolated from skin ulcers of sea-farmed fish, and description of Tenacibaculum finnmarkense sp. nov. with subdivision into genomovars finnmarkense and ulcerans Olsen, Anne Berit; Spilsberg, Bjorn; Nilsen, Hanne K.; Lagesen, Karin; Gulla, Snorre; Avendano-Herrera, Ruben; Irgang, Rute; Duchaud, Eric; Colquhoun, Duncan J. Article ISI INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2020)
Transcriptomic Profiling of the Adaptive and Innate Immune Responses of Atlantic Salmon to Renibacterium salmoninarum Infection Eslamloo, Khalil; Caballero-Solares, Albert; Inkpen, Sabrina M.; Emam, Mohamed; Kumar, Surendra; Bouniot, Camila; Avendano-Herrera, Ruben; Jakob, Eva; Rise, Matthew L. Article ISI FRONTIERS IN IMMUNOLOGY (2020)
Zebrafish (Danio rerio) as an animal model for bath infection by Flavobacterium psychrophilum AvendaÃ±o-Herrera R.; Benavides I.; Espina J.A.; Soto-Comte D.; Poblete-Morales M.; ValdÃ©s J.A.; FeijÃ³o C.G.; Reyes A.E. Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2020)
A high-throughput analysis of biofilm formation by the fish pathogen Tenacibaculum dicentrarchi Levipan, HA; Irgang, R; Tapia-Cammas, D; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2019)
Addressing viral and bacterial threats to salmon farming in Chile: historical contexts and perspectives for management and control Figueroa, Jaime; Carcamo, Juan; Yanez, Alejandro; Olavarria, Victor; Ruiz, Pamela; Manriquez, Rene; Munoz, Claudio; Romero, Alex; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI SCOPUS REVIEWS IN AQUACULTURE (2019)
Analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with antibiotic resistance genes in Chilean Piscirickettsia salmonis strains Figueroa, Jaime; Castro, Diana; Lagos, Fernando; Cartes, Carlos; Isla, Adolfo; Yáñez, Alejandro J.; Avendaño?Herrera, Rubén; Haussmann, Denise Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2019)
Biofilm development and cell viability: An undervalued mechanism in the persistence of the fish pathogen Tenacibaculum maritimum Levipan H.A.; Tapia-Cammas D.; Molina V.; Irgang R.; Toranzo A.E.; MagariÃ±os B.; AvendaÃ±o-Herrera R. Article ISI SCOPUS AQUACULTURE (2019)
Effect of Flavobacteriurn psychrophilum on the neuroendocrine response of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) in a time course experiment Munoz, J. L. P.; Ocarnpos, D.; Poblete-Morales, M.; Oyarzun, R.; Morera, F. J.; Tapia-Cammas, D.; Avendano-Herrera, R.; Vargas-Chacoff, L. Article ISI SCOPUS COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY A-MOLECULAR & INTEGRATIVE PHYSIOLOGY (2019)
Evidence for the facultative intracellular behaviour of the fish pathogen Vibrio ordalii Avendano-Herrera, Ruben; Arias-Munoz, Eloisa; Rojas, Veronica; Toranzo, Alicia E.; Poblete-Morales, Matias; Cordova,Claudio; Irgang, Rute Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2019)
First description of health status and associated bacterial diversity from non-native Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha Walbaum 1792) naturalised in a large river system from southern Chile Irgang R; Poblete-Morales M; Gomez-Uchida, D.; Avendaño-Herrera R Article BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2019)
First detection of spring viraemia of carp virus in common carp (Cyprinus carpio L.) affected by a septicaemic disease in Mexico Ortega C.; CaÃ±as-Lopez L.; Irgang R.; Fajardo R.; Poblete-Morales M.; Valladares-Carranza B.; Tapia-Cammas D.; AvendaÃ±o-Herrera R. Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2019)
High doses of Francisella noatunensis induces an immune response in Eleginops maclovinus Vargas-Lagos, C.; Martínez, D.; Oyarzún, R.; Avendaño-Herrera, R.; Yáñez, A.J.; Pontigo, J.P.; Vargas-Chacoff, L. Article ISI SCOPUS FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY (2019)
Multilocus sequence typing detects new Piscirickettsia salmonis hybrid genogroup in Chilean fish farms: Evidence for genetic diversity and population structure Isla A.; Saldarriaga-CÃ³rdoba M.; Fuentes D.E.; Albornoz, R.; Haussmann, D.; Mancilla-Schulz J.; MartÃnez A.; Figueroa J.; AvendaÃ±o-Herrera R.; YÃ¡Ã±ez A. Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2019)
Paracoccus nototheniae sp. nov., isolated from a black rock cod fish (Notothenia coriiceps) from the Chilean Antarctic Kaempfer, Peter; Irgang, Rute; Poblete-Morales, Matias; Fernandez-Negrete, Guillermo; Glaeser, Stefanie P.; Fuentes-Messina, Derie; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2019)
PCR protocol for Tenacibaculum dicentrarchi: updated specificity for "Tenacibaculum finnmarkense" detection Avendaño-Herrera R; Saldarriaga-Córdoba M; Irgang R; Tapia-Cammas D Article BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2019)
Proposal of Pedobacter nototheniae sp. nov., isolated from the spleen of a black rock cod (Notothenia coriiceps, Richardson 1844) from the Chilean Antarctica Kaempfer, Peter; Irgang, Rute; Fernandez-Negrete, Guillermo; Busse, Hans-Juergen; Poblete-Morales, Matias; Fuentes-Messina, Derie; Glaeser, Stefanie P.; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI SCOPUS ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY (2019)
Renibacterium salmoninarum iron-acquisition mechanisms and ASK cell line infection: Virulence and immune response Bethke, Jorn; Arias-Munoz, Eloisa; Yanez, Alejandro; Avendano-Herrera, Ruben Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2019)
The Fish Pathogen Vibrio ordalii Under Iron Deprivation Produces the Siderophore Piscibactin Ruiz, Pamela; Balado, Miguel; Fuentes-Monteverde, Juan Carlos; Toranzo, Alicia E.; Rodriguez, Jaime; Jimenez, Carlos; Avendano-Herrera, Ruben; Lemos, Manuel L. Article ISI SCOPUS MICROORGANISMS (2019)
Comparative Genomic Analysis of Two Chilean Renibacterium salmoninarum Isolates and the Type Strain ATCC 33209(T) Bethke, J; Yanez, AJ; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION (2018)
Comparative Genomics of Tenacibaculum dicentrarchi and Tenacibaculum finnmarkens Highlights Intricate Evolution of Fish-Pathogenic Species Bridel, S; Olsen, AB; Nilsen, H; Bernardet, JF; Achaz, G; Avendano-Herrera, R; Duchaud, E Article ISI SCOPUS GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION (2018)
Detection of muscle-specific creatine kinase expression as physiological indicator for Atlantic salmon (Salmo salar L) skeletal muscle damage Rojas, V; Morales-Lange, B; Avendano-Herrera, R; Poblete-Morales, M; Tapia-Cammas, D; Guzman, F; Marshall, SH; Mercado, L Article ISI SCOPUS AQUACULTURE (2018)
First identification and characterization of Streptococcus iniae obtained from tilapia (Oreochromis aureus) farmed in Mexico Ortega, C; Garcia, I; Irgang, R; Fajardo R.; Tapia-Cammas, D; Acosta, J; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2018)
Genomic Diversity and Evolution of the Fish Pathogen Flavobacterium psychrophilum Duchaud, E; Rochat, T; Habib, C; Barbier, P; Loux, V; Guerin, C; Dalsgaard, I; Madsen, L; Nilsen, H; Sundell, K; Wiklund, T; Strepparava, N; Wahli, T; Caburlotto, G; Manfrin, A; Wiens, GD; Fujiwara-Nagata, E; Avendano-Herrera, R; Bernardet, JF; Nicolas, P Article ISI SCOPUS FRONTIERS IN MICROBIOLOGY (2018)
In vitro genomic and proteomic evidence of a type IV pili-like structure in the fish pathogen Piscirickettsia salmonis Sanchez, P; Oliver, C; Hernandez, M; Cortes, M; Rauch MC; Valenzuela, K; Garduno, RA; Avendano-Herrera, R; Yanez, AJ Article ISI FEMS MICROBIOLOGY LETTERS (2018)
Isolation characterization, virulence potential of Weissella ceti responsible for weissellosis outbreak in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) cultured in Mexico CastrejÃ³n-NÃ¡jera J.; Ortega C.; Fajardo R.; Irgang R.; Tapia-Cammas D.; Poblete-Morales M.; AvendaÃ±o-Herrera R. Article ISI SCOPUS Transboundary and Emerging Diseases (2018)
PCR procedure for detecting the fish pathogen Tenacibaculum dicentrarchi Avendano-Herrera, R; Irgang, R; Tapia-Cammas, D Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2018)
Physiological evidence that Piscirickettsia salmonis produces siderophores and uses iron from different sources Yanez, A. J.; Haro, R.; Calquin, P.; Oliva, H.; Oliver, C.; Vargas-Chacoff, L.; Ruiz, P.; Avendano-Herrera, R.; Sanchez, P. Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2018)
Stress Tolerance-Related Genetic Traits of Fish Pathogen Flavobacterium psychrophilum in a Mature Biofilm Levipan, HA; Quezada, J; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS FRONTIERS IN MICROBIOLOGY (2018)
Biochemical, serological, and genetic characterization of Renibacterium salmoninarum isolates recovered from salmonids in Chile Bethke J; Quezada, J.; Poblete-Morales M; Irgang R; Yañez A; Oliver C; Avendaño-Herrera R Article BULLETION OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2017)
Comparative genome analysis of two Streptococcus phocae subspecies provides novel insights into pathogenicity Bethke J.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS MARINE GENOMICS (2017)
Cytotoxic activity of Flavobacterium psychrophilum in skeletal muscle cells of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Iturriaga M.; Espinoza M.B.; Poblete-Morales M.; Feijoo C.G.; Reyes A.E.; Molina A.; Avendaño-Herrera R.; Valdés J.A. Article ISI SCOPUS VETERINARY MICROBIOLOGY (2017)
Different Phenotypes of Mature Biofilm in Flavobacterium psychrophilum Share a Potential for Virulence That Differs from Planktonic State Levipan H.A.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY (2017)
Disease caused by Yersinia ruckeri serotype O2b found in Chilean-farmed coho salmon, Oncorhynchus kisutch (Walbaum, 1792) Avendaño-Herrera R.; Tapia-Cammas D.; Aedo A.; Saldivia, P.; Ortega C.; Irgang, R Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2017)
First identification and characterization of Tenacibaculum dicentrarchi isolated from Chilean red conger eel (Genypterus chilensis, Guichenot 1848) Irgang R.; González-Luna R.; Gutiérrez J.; Poblete-Morales M.; Rojas V.; Tapia-Cammas D.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2017)
First isolation and characterization of Flavobacterium psychrophilum from diseased rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) farmed in Mexico CASTILLO, Y; Ortega, C; Fajardo R; Martínez-Castaneda S; Valladares B; Irgang R; poblete, m; Avendaño-Herrera R Article BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2017)
Fish skeletal muscle tissue is an important focus of immune reactions during pathogen infection Valenzuela, Cristián A.; Zuloaga, Rodrigo; Poblete-Morales, Matías; Vera-Tobar, Tamara; Mercado, Luis; Avendaño-Herrera, Ruben; Valdés, Juan Antonio; Molina, Alfredo Article ISI SCOPUS DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY (2017)
Identification of chemotaxis operon cheYZA and cheA gene expression under stressful conditions in Piscirickettsia salmonis Albornoz, Romina; Valenzuela, Karla; Pontigo, Juan P.; Sánchez, Patricio; Ruiz, Pamela; Avendaño-Herrera, Ruben; Romero, Alex; Oliver, Cristian; Yáñez, Alejandro Article ISI SCOPUS MICROBIAL PATHOGENESIS (2017)
Psychromonas aquatilis sp nov., isolated from seawater samples obtained in the Chilean Antarctica Kämpfer P.; Irgang R.; Poblete-Morales M.; Glaeser S.P.; Martín M.C.S.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2017)
The Proteome of Biologically Active Membrane Vesicles from Piscirickettsia salmonis LF-89 Type Strain Identifies Plasmid-Encoded Putative Toxins Oliver, Cristian; Hernández, Mauricio A.; Tandberg, Julia I.; Valenzuela, Karla N.; Lagos, Leidy X.; Haro, Ronie E.; Sánchez, Patricio; Ruiz, Pamela A.; Sanhueza-Oyarzún, Constanza; Cortés, Marcos A.; Villar, María T.; Artigues, Antonio; Winther-Larsen, Hanne C.; Avendaño-Herrera, Ruben; Yáñez, Alejandro J. Article ISI SCOPUS Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (2017)
Universal probe library assay for the detection of infectious pancreatic necrosis virus genogroups 1 and 5 in salmonid tissues Avendaño-Herrera R.; Tobar J.A.; Tobar I.; Fernández-Caro C. Article ISI SCOPUS AQUACULTURE RESEARCH (2017)
Case Report: Strawberry Disease in Farmed Chilean Rainbow Trout Sandoval C.; Infante, J.; Abad J.; Ferguson H.W.; Paredes, E; Valdebenito S.; Yáñez A.J.; Ilardi, P.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS JOURNAL OF AQUATIC ANIMAL HEALTH (2016)
Characterization and pathogenic role of outer membrane vesicles produced by the fish pathogen Piscirickettsia salmonis under in vitro conditions Oliver C.; Valenzuela K.; Hernandez, M.; Sandoval, R; Haro RE; Avendano-Herrera, R; Carcamo, JG; Villar, MT; Artigues, A; Garduno, R; Yanez, AJ Article ISI SCOPUS VETERINARY MICROBIOLOGY (2016)
Comparative analysis of innate immune responses to Streptococcus phocae strains in Atlantic salmon (Salmo salar) and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Salazar, S; Oliver C.; Yáñez A.J.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS FISH & SHELLFISH IMMUNOLOGY (2016)
First identification of Francisella noatunensis subsp orientalis causing mortality in Mexican tilapia Oreochromis spp. Ortega, C; Mancera, G; Enríquez, R; Vargas, A; Martinez, S; Fajardo, R; Avendano-Herrera, R; Navarrete, MJ; Romero, A Article ISI SCOPUS DISEASES OF AQUATIC ORGANISMS (2016)
Iron acquisition and siderophore production in the fish pathogen Renibacterium salmoninarum Bethke, J; Poblete-Morales, M; Irgang, R; Yanez, A; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2016)
Iron assimilation and siderophore production by Vibrio ordalii strains isolated from diseased Atlantic salmon Salmo salar in Chile Ruiz, P; Balado M.; Toranzo A.E.; Poblete-Morales, M; Lemos M.L.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS DISEASES OF AQUATIC ORGANISMS (2016)
Isolation, Characterization and Virulence Potential of Tenacibaculum dicentrarchi in Salmonid Cultures in Chile Avendano-Herrera, R; Irgang, R; Sandoval C.; Moreno-Lira, P; Houel A.; Duchaud, E; Poblete-Morales, M; Nicolas, P; Ilardi, P. Article ISI SCOPUS Transboundary and Emerging Diseases (2016)
Predominant bacteria associated with black rock cod (Notothenia coriiceps Richardson 1844) from King George island, Antarctica Avendaño-Herrera R; Irgang R; Poblete-Morales M; Vásquez-Martinez Y; Robles C; Toro-Ascuy D.; Cortez-San Martin, M. Article BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2016)
Pseudoduganella danionis sp nov., isolated from zebrafish (Danio rerio) Kampfer, P; Irgang, R; Busse, HJ; Poblete-Morales, M; Kleinhagauer, T; Glaeser, SP; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2016)
Survival behaviour and virulence of the fish pathogen Vibrio ordalii in seawater microcosms Ruiz, P; Poblete-Morales, M; Irgang, R; Toranzo A.E.; Avendaño-Herrera R. Article ISI SCOPUS DISEASES OF AQUATIC ORGANISMS (2016)
Undibacterium danionis sp nov isolated from a zebrafish (Danio rerio) Kampfer, P; Irgang, R; Busse, HJ; Poblete-Morales, M; Kleinhagauer, T; Glaeser, SP; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2016)
Bacteria associated with mass mortality of post-larvae of red conger eel (Genypterus chilensis) cultured in a Chilean farm Levican A.; Avendano-Herrera, R Article ISI BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2015)
Bacterial lipopolysaccharide induces rainbow trout myotube atrophy via Akt/FoxO1/Atrogin-1 signaling pathway Aedo, JE; Reyes, AE; Avendano-Herrera, R; Molina A.; Valdes, JA Article ISI SCOPUS Acta Biochimica et Biophysica Sinica (2015)
Cell-surface properties of Vibrio ordalii strains isolated from Atlantic salmon Salmo salar in Chilean farms Ruiz, P; poblete, m; Yáñez A.J.; Irgang, R; Toranzo A.E.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS DISEASES OF AQUATIC ORGANISMS (2015)
Effectiveness of egg yolk immunoglobulin against the intracellular salmonid pathogen Piscirickettsia salmonis Oliver C.; Valenzuela K.; Silva H.; Haro RE; Cortes, M; Sandoval, R; Pontigo, JP; Alvarez C.; Figueroa JE; Avendano-Herrera, R; Troncoso, JM; Yanez, AJ Article ISI SCOPUS Journal of Applied Microbiology (2015)
Genome Sequence of Streptococcus phocae subsp. phocae Strain ATCC 51973(T) Isolated from a Harbor Seal (Phoca vitulina) Avendano-Herrera, Ruben; Poblete-Morales, Matias Article WOS-ESCI MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS (2015)
Isolation and identification of Vibrio toranzoniae associated with diseased red conger eel (Genypterus chilensis) farmed in Chile Lasa, A; Avendano-Herrera, R; Estrada, JM; Romalde JL Article ISI SCOPUS Veterinary Microbiology (2015)
Neutrophil Migration in the Activation of the Innate Immune Response to Different Flavobacterium psychrophilum Vaccines in Zebrafish (Danio rerio) Solis, CJ; Poblete-Morales, M; Cabral, S; Valdes, JA; Reyes, AE; Avendano-Herrera, R; Feijoo, CG Article ISI SCOPUS Journal of Immunology Research (2015)
A non-destructive method for rapid detection of Tenacibaculum maritimum in farmed fish using nested PCR amplification Avendaño-Herrera R, Nuñez S, Magariños B, Toranzo AE. Article ISI BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2014)
A novel O-serotype in Tenacibaculum maritimum strains isolated from cultured sole (Solea senegalensis). Avendaño-Herrera R, Magariños B, Moriñigo M, Romalde JL, Toranzo AE. Article ISI BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2014)
Broth microdilution protocol for minimum inhibitory concentration (MIC) determinations of the intracellular salmonid pathogen Piscirickettsia salmonis to florfenicol and oxytetracycline Yáñez A.J.; Valenzuela K.; Matzner, C; Olavarria, V; Figueroa J.; Avendano-Herrera, R; Cárcamo J.G. Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2014)
Comparative polyphasic characterization of Streptococcus phocae strains with different host origin and description of the subspecies Streptococcus phocae subsp salmonis subsp nov. Avendano-Herrera, R; Balboa, S; Castro N.; Gonzalez-Contreras, A; Magarinos, B; Fernandez, J; Toranzo AE; Romalde JL Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2014)
Flavobacterium chilense and Flavobacterium spartansii, two novel non-pathogenic species to rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) obtained from Rio Blanco fish farm in Chile Avendano-Herrera, R; Ceballos, C; Ramírez L.; Poblete-Morales, M; Irgang, R Article ISI SCOPUS BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2014)
Genome Sequence of Streptococcus phocae subsp. salmonis Strain C-4T, Isolated from Atlantic Salmon (Salmo salar). Avendaño-Herrera, Ruben; Suarez, Rudy; Lazo, Eduardo; Bravo, Diego; Llegues, Katerina O; Romalde, Jesús L; Godoy, Marcos G Article Genome announcements (2014)
Identification of Streptococcus phocae straits associated with motality of Atlantic salmon (Salmo salar) cultured at low temperature in Chile Yáñez AJ, Godoy MG, Gallardo A, Avendaño-Herrera R. Article ISI BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2014)
Introduction, expansion and coexistence of epidemic Flavobacterium psychrophilum lineages in Chilean fish farms Avendaño-Herrera R.; Houel A.; Irgang, R; Bernardet J.-F.; Godoy M.; Nicolas, P; Duchaud, E Article ISI SCOPUS VETERINARY MICROBIOLOGY (2014)
PCR protocol for detection of Vibrio ordalii by amplification of the vohB (hemolysin) gene Avendano-Herrera, R; Maldonado, JP; Tapia-Cammas, D; Feijoo, CG; Calleja F.; Toranzo AE Article ISI DISEASES OF AQUATIC ORGANISMS (2014)
From the Flavobacterium genus to the phylum Bacteroidetes: genomic analysis of dnd gene clusters Barbier, P; Lunazzi, A; Fujiwara-Nagata, E; Avendano-Herrera, R; Bernardet, JF; Touchon, M; Duchaud, E Article ISI SCOPUS FEMS Microbiology Letters (2013)
Identification of Streptococcus phocae strains associated with mortality of Atlantic salmon (Salmo salar) farmed at low temperature in Chile Yanez, AJ; Godoy MG; Gallardo, A.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Bulletin of the European Association of Fish Pathologists (2013)
Infectious salmon anaemia virus (ISAV) in Chilean Atlantic salmon (Salmo salar) aquaculture: emergence of low pathogenic ISAV-HPR0 and re-emergence of virulent ISAV-HPR Delta: HPR3 and HPR14 Godoy MG; Kibenge, MJT; Suarez, R; Lazo, E; Heisinger A; Aguinaga J; Bravo D.; Mendoza J.; Llegues KO; Avendano-Herrera, R; Vera C.; Mardones F.; Kibenge FSB Article ISI SCOPUS VIROLOGY JOURNAL (2013)
Soybean Meal Induces Intestinal Inflammation in Zebrafish Larvae Hedrera, MI; Galdames, JA; Jimenez-Reyes, MF; Reyes, AE; Avendano-Herrera, R; Romero J.; Feijoo, CG Article ISI SCOPUS PLOS ONE (2013)
Two novel blood-free solid media for the culture of the salmonid pathogen Piscirickettsia salmonis YaÃ±ez A.J.; Silva H.; Valenzuela K.; Pontigo, J.P.; Godoy M.; Troncoso J.; Romero A.; Figueroa J.; Carcamo J.G.; AvendaÃ±o-Herrera R. Article ISI SCOPUS Journal of Fish Diseases (2013)
Vibrio ordalii antimicrobial susceptibility testing-Modified culture conditions required and laboratory-specific epidemiological cut-off values Poblete-Morales, M; Irgang, R; Henriquez-Nunez, H; Toranzo AE; Kronvall, G; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Veterinary Microbiology (2013)
Antimicrobial susceptibility and plasmid profiles of Flavobacterium psychrophilum strains isolated in Chile Henriquez-Nunez, H; Evrard, O; Kronvall, G; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Aquaculture (2012)
Broth medium for the successful culture of the fish pathogen Piscirickettsia salmonis Yáñez A.J.; Valenzuela K.; Silva H.; Retamales J.; Romero A.; Enríquez R.; Figueroa J.; Claude A.; Gonzalez, J; Avendano-Herrera, R; Cárcamo J.G. Article ISI SCOPUS Diseases of Aquatic Organisms (2012)
Flavobacterium chilense sp nov and Flavobacterium araucananum sp nov., isolated from farmed salmonid fish Kampfer P; Lodders N.; Martin K.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2012)
Infectivity study of Streptococcus phocae to seven fish and mammalian cell lines by confocal microscopy Cortez San Martín M.; Gonzalez-Contreras, A; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Journal of Fish Diseases (2012)
Iron utilization and siderophore production by Streptococcus phocae isolated from diseased Atlantic salmon (Salmo salar) Retamales J.; Gonzalez-Contreras, A; Salazar, S; Toranzo A.E.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Aquaculture (2012)
Use of reverse transcription-real time polymerase chain reaction (real time RT-PCR) assays with Universal Probe Library (UPL) probes for the detection and genotyping of infectious pancreatic necrosis virus strains isolated in Chile Calleja F.; Godoy M.G.; CÃ¡rcamo J.G.; BandÃn I.; YÃ¡Ã±ez A.J.; Dopazo C.P.; Kibenge F.S.; AvendaÃ±o-Herrera R. Article ISI SCOPUS Journal of Virological Methods (2012)
Chryseobacterium chaponense sp. nov., isolated from farmed Atlantic salmon (Salmo salar) Kampfer P; Fallschissel K.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2011)
Effect of emamectin benzoate on transcriptional expression of cytochromes P450 and the multidrug transporters (Pgp and MRP1) in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) and the sea lice Caligus rogercresseyi Carcamo, JG; Aguilar, MN; Barrientos, CA; Carreno, CF; Quezada, CA; Bustos C.; Manriquez, RA; Avendano-Herrera, R; Yanez, AJ Article ISI SCOPUS Aquaculture (2011)
Efficacy of a commercial disinfectant against Vibrio ordalii, Vibrio anguillarum, Francisella sp and Infectious Pancreatic Necrosis Virus (IPNV) pathogens of Atlantic salmon (Salmo salar) farmed in Chile Muller, M.; Ilardi, P.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCIELO SCOPUS ARCHIVOS DE MEDICINA VETERINARIA (2011)
Estimation of epidemiological cut-off values for disk diffusion susceptibility test data for Streptococcus phocae Avendano-Herrera, R; Molina A.; Magarinos, B; Toranzo AE; Smith P. Article ISI SCOPUS Aquaculture (2011)
Flavobacterium columnare associated with mortality of salmonids farmed in Chile: a case report of two outbreaks Avendano-Herrera, R; Gherardelli V; Olmos, P; Godoy MG; Heisinger A; Fernandez, J Article ISI SCOPUS Bulletin of the European Association of Fish Pathologists (2011)
Flavobacterium columnare associated with mortality of salmonids farmed in Chile: a case report of two outreaks Avendaño-Herrera R; Gherardelli V; Olmos, P.; Godoy MG; Heisinger A; Fernández J Article BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2011)
Multiplex PCR for the detection of Piscirickettsia salmonis, Vibrio anguillarum, Aeromonas salmonicida and Streptococcus phocae in Chilean marine farms Tapia-Cammas, D; Yañez A.; Arancibia, G.; Toranzo AE; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Diseases of Aquatic Organisms (2011)
Pseudo-membranes on internal organs associated with Rhodococcus qingshengii infection in Atlantic salmon (Salmo salar) Avendano-Herrera, R; Balboa, S; Doce, A; Ilardi, P.; Lovera P.; Toranzo AE; Romalde JL Article ISI SCOPUS Veterinary Microbiology (2011)
Surface properties of Streptococcus phocae strains isolated from diseased Atlantic salmon, Salmo salar L. Gonzalez-Contreras, A; Magarinos, B; Godoy M.; Irgang, R; Toranzo AE; Avendano-Herrera, R Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2011)
Acylhomoserine lactone production and degradation by the fish pathogen Tenacibaculum maritimum , a member of the Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides (CFB) group Romero, Manuel; Avendaño-Herrera, Ruben; Magariños, Beatriz; Cámara, Miguel; Otero, Ana Article FEMS MICROBIOLOGY LETTERS (2010)
First description of atypical furunculosis in freshwater farmed Atlantic salmon, Salmo salar L., in Chile Godoy M.; Gherardelli V; Heisinger A; Fernandez, J; Olmos, P; Ovalle L.; Ilardi, P.; Avendano-Herrera, R Article ISI JOURNAL OF FISH DISEASES (2010)
Phenotypic, serological and molecular evidence of Chryseobacterium piscicola in farmed Atlantic salmon, Salmo salar L., in Finland Ilardi, P.; Abad J.; Rintamaki, P; Bernardet, JF; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Journal of Fish Diseases (2010)
TaqMan (R) real-time RT-PCR detection of infectious salmon anaemia virus (ISAV) from formalin-fixed paraffin-embedded Atlantic salmon Salmo salar tissues Godoy MG; Kibenge, FS; Kibenge, MJ; Olmos, P; Ovalle L.; Yanez, AJ; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS Diseases of Aquatic Organisms (2010)
Analysis of 16S-23S rRNA gene internal transcribed spacer of Vibrio anguillarum and Vibrio ordalii strains isolated from fish Fernandez, J; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS FEMS MICROBIOLOGY LETTERS (2009)
Chryseobacterium piscicola sp nov., isolated from diseased salmonid fish Ilardi, P.; Fernandez, J; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2009)
Genetic characterization of Streptococcus phocae strains isolated from Atlantic salmon, Salmo salar L., in Chile Valdes, I; Jaureguiberry, B; Romalde JL; Toranzo AE; Magarinos, B; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2009)
Identification of Flexibacter maritimus or Tenacibaculum maritimum from post-larvae of Litopenaeus vannamei ?. Comment on Mourino et al. (2008) Avendano-Herrera, R Article BRAZILIAN JOURNAL OF BIOLOGY (2009)
Identification of Flexibacter maritimus or Tenacibaculum maritimum from post-larvae of Litopenaeus vannamei?. Comment on Mouriño et al. (2008) Avendano-Herrera, R Article SCOPUS BRAZILIAN JOURNAL OF BIOLOGY (2009)
Molecular analysis of Flavobacterium psychrophilum isolates from salmonid farms in Chile Avendano-Herrera, R; Araya, P; Fernandez, J Article ISI SCOPUS BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2009)
Phenotypic, serological and genetic characterization of Flavobacterium psychrophilum strains isolated from salmonids in Chile Valdebenito S.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2009)
Antigenic and molecular characterization of Vibrio ordalii strains isolated from Atlantic salmon Salmo salar in Chile Silva-Rubio, A; Acevedo, C; Magarinos, B; Jaureguiberry, B; Toranzo AE; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS DISEASES OF AQUATIC ORGANISMS (2008)
Evolution of drug resistance and minimum inhibitory concentration to enrofloxacin in Tenacibaculum maritimum strains isolated in fish farms Avendaño-Herrera, Ruben; Núñez, Soledad; Barja, Juan L.; Toranzo, Alicia E. Article AQUACULTURE INTERNATIONAL (2008)
First description of serotype O3 in Vibrio anguillarum strains isolated from salmonids in Chile Silva-Rubio, A; Avendano-Herrera, R; Jaureguiberry, B; Toranzo AE; Magarinos, B Article ISI SCOPUS JOURNAL OF FISH DISEASES (2008)
Isolation of Flavobacterium-like bacteria from diseased salmonids cultured in Chile Ilardi, P.; Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2008)
Simultaneous evaluation of four PCR primer sets for the diagnosis of Streptococcus phocae infection Avendano-Herrera, R Article ISI SCOPUS DISEASES OF AQUATIC ORGANISMS (2008)
Streptococcus phocae, an emerging pathogen for salmonid culture Romalde JL; Ravelo C; Valdes, I; Magarinos, B; De La Fuente E.; Martin, CS; Avendano-Herrera, R; Toranzo AE Article ISI SCOPUS VETERINARY MICROBIOLOGY (2008)
Evaluation of different DNA-based fingerprinting methods for typing Photobacterium damselae ssp. piscicida MANCUSO, MONIQUE; Avendaño-Herrera, Ruben; ZACCONE, R; Toranzo, Alicia E.; Magariños, Beatriz Article SCIELO BIOLOGICAL RESEARCH (2007)
Production of a diatom-bacteria biofilm in a photobioreactor for aquaculture applications Avendano-Herrera, RE; Riquelme, CE Article ISI SCOPUS AQUACULTURAL ENGINEERING (2007)
A challenge model for Tenacibaculum maritimum infection in turbot, Scophthalmus maximus (L.) Avendano-Herrera, R; Toranzo A.E.; Magarinos, B Article JOURNAL OF FISH DISEASES (2006)
Flexibactteriosi da Tenacibaculum maritimum sierotipo O3 in pesce capone (Chelidonichthys lucerna L.) d´allevamento: prima segnalazione in Italia Magi GE; Avendaño-Herrera R; Toranzo AE; Romalde JL Article ITTIOPATOLOGIA (2006)
Tenacibaculosis infection in marine fish caused by Tenacibaculum maritimum: a review Avendano-Herrera, R; Toranzo AE; Magarinos, B Article Diseases of Aquatic Organisms (2006)
Use of hydrogen peroxide against the fish pathogen Tenacibaculum maritimum and its effect on infected turbot (Scophthalmus maximus) Avendaño-Herrera, Ruben; Magariños, Beatriz; Irgang, Rute; Toranzo, Alicia E. Article AQUACULTURE (2006)
Use of microcosms to determine the survival of the fish pathogen Tenacibaculum maritimum in seawater Avendaño-Herrera, Ruben; Irgang, Rute; Magariños, Beatriz; Romalde, Jesus L.; Toranzo, Alicia E. Article Environmental Microbiology (2006)
Iron Uptake Mechanisms in the Fish Pathogen Tenacibaculum maritimum Avendano-Herrera, R; Toranzo A.E.; Romalde J.L.; Lemos M.L.; Magarinos, B Article APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY (2005)
Producción de substancias inhibitorias entre bacterias de biopelículas en substratos marinos Avendaño-Herrera, Ruben; Lody, Mario; Riquelme, Carlos E. Article SCIELO REVISTA DE BIOLOGIA MARINA Y OCEANOGRAFIA (2005)
Recommendation of an Appropriate Medium for In Vitro Drug Susceptibility Testing of the Fish Pathogen Tenacibaculum maritimum Avendano-Herrera, R; Irgang, R; Nunez, S; Romalde J.L.; Toranzo A.E. Article ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY (2005)
Intraspecific diversity of the marine fish pathogen Tenacibaculum maritimum as determined by randomly amplified polymorphic DNA-PCR Avendano-Herrera, R; Rodriguez J.; Magarinos, B; Romalde J.L.; Toranzo A.E. Article Journal of applied microbiology (2004)
Phenotypic characterization and description of two major O-serotypes in Tenacibaculum maritimum strains from marine fishes Avendano-Herrera, R; Magarinos, B; López-Romalde, S; Romalde JL; Toranzo AE Article Diseases of Aquatic Organisms (2004)
Species-specific polymerase chain reaction primer sets for the diagnosis of Tenacibaculum maritimum infection Avendano-Herrera, R; Magarinos, B; Toranzo AE; Beaz, R; Romalde JL Article Diseases of Aquatic Organisms (2004)
Optimization of settlement of larval Argopecten purpuratus using natural diatom biofilms Avendano-Herrera, R; Riquelmes, C; Silva, F; Avendanod, M; Irgang, R Article ISI SCOPUS JOURNAL OF SHELLFISH RESEARCH (2003)
Utilización de biopelículas bacterianas en el asentamiento de larvas de Argopecten purpuratus (Lamarck 1819) en un hatchery comercial AVENDAÑO-HERRERA, RUBÉN E.; Riquelme, Carlos E.; Silva, Fernando Article SCIELO REVISTA DE BIOLOGIA MARINA Y OCEANOGRAFIA (2002)
Addition of inhibitor-producing bacteria to mass cultures of Argopecten purpuratus larvae (Lamarck, 1819) Riquelme, CE; Jorquera, MA; Rojas, AI; Avendano, RE; Reyes, N Article ISI SCOPUS AQUACULTURE (2001)
Establecimiento de bacterias benéficas en el tracto digestivo y gónada de adultos de Argopecten purpuratus (Lamarck 1819) en cultivo masivo AVENDAÑO-HERRERA, RUBÉN E.; Dekovic, Marcelo; Riquelme, Carlos E. Article SCIELO REVISTA DE BIOLOGIA MARINA Y OCEANOGRAFIA (2001)
Establishment of mixed-culture probiotics and microalgae as food for bivalve larvae Riquelme, C.E.; Avendano R.E. Article AQUACULTURE RESEARCH (1999)
Comparative polyphasic characterization of Streptococcus phocae strains with different host origin and description of the subspecies Streptococcus phocae subsp. salmonis subsp. nov. Avendaño-Herrera R, Balboa S, Castro N, González-Contreras A, Magariños B, Fernández J, Toranzo AE, Romalde JL. Article INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY
Flavobacterium chilense and Flavobacterium spartansii, two novel non-pathogenic species to rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum). Avendaño-Herrera R, Ceballos C, Ramírez L, Poblete-Morales M, Irgang R. Article BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS
Sobrevivencia y crecimiento de post-larvas de Argopecten purpuratus (Lamarck, 1819) en Bahía Inglesa, Chile: efectos del origen, distribución en la bahía y bacterioflora larval AVENDAÑO, RUBÉN E.; Riquelme, Carlos E.; Escribano, Rubén; REYES, NELSON Article Revista chilena de historia natural


Tenacibaculosis Olsen AB; Powell, J.; Siah A; Colquhoun DJ; Avendaño-Herrera R; Brun E; Rodriguez JF; Macdonald A BookSection (2019)
Vibriosis: Vibrio anguillarum, V. ordalii and Aliivibrio salmonicida Toranzo AE; Magariños B; Avendaño-Herrera R; Woo PTK; Cipriano RC BookSection (2017)
Tenacibaculosis: Tenacibaculum maritimum Avendaño-Herrera R; Toranzo AE; Romalde JL; Magariños B; Angelidis P BookSection (2013)
Estreptococcosis Avendaño-Herrera R; Toranzo AE; Romalde JL; Avendaño-Herrera R BookSection (2011)
Flavobacteriosis Irgang R; Vega, R; Avendaño-Herrera R; Avendaño-Herrera R BookSection (2011)
Vibriosis Toranzo AE; Avendaño-Herrera R; Lemos ML; Osorio CR; Avendaño-Herrera R BookSection (2011)
Vaccination strategies to prevent important emerging diseases for Spanish aquaculture Romalde JL; Ravelo C; López-Romalde S; Avendaño-Herrera R; Magariños B; Toranzo AE; Mydtlyng PJ BookSection (2005)


Enfermedades infecciosas del cultivo de salmónidos en Chile y en el mundo Avendaño-Herrera R; Avendaño-Herrera R BookWhole (2011)


First reports of flexibacteriosis in farmed tub gurnard (Chelidonichthys lucernus L.) and wild turbot (Scophthalmus maximus) in Italy Magi G.E.; Avendano-Herrera, R; Magarinos, B; Toranzo A.E.; Romalde J.L. ConferencePaper BULLETIN OF THE EUROPEAN ASSOCIATION OF FISH PATHOLOGISTS (2007)


Proper antibiotics use in the Chilean salmon industry: Policy and technology bottlenecks Avendano-Herrera, R EditorialMaterial ISI SCOPUS AQUACULTURE (2018)


Resistance-nodulation-division efflux pump acrAB is modulated by florfenicol and contributes to drug resistance in the fish pathogen Piscirickettsia salmonis Sandoval, R; Oliver C.; Valdivia, S; Valenzuela K.; Haro R.E.; Sánchez P.; Olavarría V.H.; Valenzuela P.; Avendaño-Herrera R.; Romero A.; Cárcamo J.G.; Figueroa J.E.; Yáñez A.J. Letter ISI SCOPUS FEMS MICROBIOLOGY LETTERS (2016)


Isolation of Vibrio tapetis from two native fish species (Genypterus chilensis and Paralichthys adspersus) reared in Chile and description of Vibrio tapetis subsp quintayensis subsp nov. Levican A.; Lasa A.; Irgang R.; Romalde J.L.; Poblete-Morales M.; Avendaño-Herrera R. Note ISI SCOPUS INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY (2017)


Anticipating instead of reacting to the imminent threat of bacterial co-infections in farmed salmon in Chile: elucidation of fish susceptibility, bacterial behavior, and treatment efficacies during a dual or multiple co-infection in Atlantic salmon (Salmo salar) by Renibacterium salmoninarum with Tenacibaculum dicentrarchi, T. maritimum, and/or Tenacibaculum spp. Ruben Avendaño-Herrera; Mónica Saldarriaga-Córdoba; Rute Irgang Proyecto (2023)
Producción y evaluación de un kit diagnóstico y una vacuna divalente adyuvantada contra Yersinia ruckeri y Weissella ceti en trucha arco iris Jefferson Yunis-Aguinaga; Ruben Avendaño-Herrera Proyecto (2021)
Comprehensive study of the biological, genetic, and molecular bases and virulence factors for the causative agent of tenacibaculosis in Chilean marine fish, Tenacibaculum dicentrarchi: an epidemiological approximation for developing prevention strategies Ruben Avendaño-Herrera; Mónica Saldarriaga-Córdoba Proyecto (2019)
Biochemical and molecular characterization of Streptococcus spp. obtained from from rainbow trout Oncorhynchus mykiss (“Caracterización bioquímica y molecular Streptococcus spp. obtenidas de trucha arcoíris Oncorhynchus mykiss”). Convocatoria de Investigación Científica, Innovación y Desarrollo UAEM 2017-2018 (México) (4489/2018/CI.) Proyecto 2017-2019 Coinvestigador(a)
Integral studies on the biological and molecular bases of the life cycle of Piscirickettsia salmonis with epidemiological approach to develop techniques that allow its control Fondo de Inversión Estrategica FIE-2015-V014 (122929) Proyecto 2017-2018 Coinvestigador(a)
Pathogen-induced immune-like response of fish skeletal muscle=> stress-induced immunosuppression and growth impairment FONDECYT (1171307) Proyecto 2017-2020 Coinvestigador(a)
ESTUDIO DEL ROL DE VESÍCULAS DE MEMBRANA EXTERNA DE PISCIRICKETTSIA SALMONIS Y SUS EFECTORES/FACTORES DE VIRULENCIA PARA EL DESARROLLO DE UNA TERAPIA PROTECTORA E INMUNO-ESTIMULANTE EN SALMÓN DEL ATLÁNTICO Y TRUCHA ARCOÍRIS. FONDECYT (3160849) Proyecto 2015-2018 Inv. Patrocinante
IDENTIFICATION AND CHARACTERIZATION OF THE IRON UPTAKE SYSTEM IN DIFFERENT CHILEAN RENIBACTERIUM SALMONINARUM ISOLATES AND ITS INFLUENCE ON PATHOGENESIS AND INMUNOGENICITY IN ATLANTIC SALMON AND RAINBOW TROUT. FONDECYT (1150695) Proyecto 2015-2019 Inv. Responsable
"Estudio biológico pesquero y sanitario de la población de salmón Chinook en la cuenca del río Toltén en la región de la Araucanía " Fondo de Investigación Pesquera (FIP 2014-87 ") Proyecto 2014-2015 Coinvestigador(a)
DETERMINACIÓN DEL ROL DEL QUORUM SENSING EN LA FORMACIÓN DE BIOPELÍCULAS DE FLAVOBACTERIUM PSYCHROPHILUM Y PISCIRICKETTSIA SALMONIS=> SECUESTRO DE SEÑALES DE COMUNICACIÓN BACTERIANA TIPO AHLS COMO ALTERNATIVA DE CONTROL BACTERIANO FONDECYT (3150505) Proyecto 2014-2017 Inv. Patrocinante
Study of viral and bacterial diversity in seawater and Antarctic fish species=> Finding of natural reservoir of salmonid pathogen XIX Concurso Nacional de Proyectos de Investigación Científica y Tecnológica Antártica 2013 (Código RT_08-13) Proyecto 2014-2016 Coinvestigador(a)
Base nacional de aislados bacterianos para la industria acuícola; un nuevo servicio para el diagnóstico, tratamiento y prevención de enfermedades de salmónidos Fundación para la Innovación Agraria - Ministerio de Agricultura (PYT-2013-0014) Proyecto 2013-2015 Inv. Principal
CENTRO INTERDISCIPLINARIO DE INVESTIGACIÓN EN ACUICULTURA SUSTENTABLE (INCAR) FONDAP (15110027) Proyecto 2013-2017 Inv. Principal
ESTUDIO DE LA MICROBIOTA ASOCIADA AL CULTIVO DE CONGRIO COLORADO (GENYPTERUS CHILENSIS) Y SELECCION DE BACTERIAS PROBIOTICAS PARA MEJORAR LA SUPERVIVENCIA DE LARVAS Y POST-LARVAS FONDECYT (3140296) Proyecto 2013-2016 Inv. Patrocinante
Estudio de los mecanismos de virulencia del patogeno acuicola Flavobacterium psychrophilum, basado en un modelo innovador de cultivo primario de celulas y larvas de peces Proyecto Nucleo DI-447-13/N – Universidad Andrés Bello (DI-447-13/N) Proyecto 2013-2015 Inv. Principal
Evaluación de la eficacia de vacunas sitio-especificas o autovacunas de inmersión para la prevención de la Flavobacteriosis causada por Flavobacterium psychrophilum en alevines de trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) Proyecto Interno Universidad Andrés Bello No. DI-99-12/R (DI-99-12/R) Proyecto 2012-2013 Inv. Principal
STUDY OF PHAGE DISPLAY STRATEGY FOR THE IMMUNIZATION OF RAINBOW TROUT (ONCORHYNCHUS MYKISS) AGAINST THE CHILEAN FRESHWATER PATHOGEN FLAVOBACTERIUM PSYCHROPHILUM FONDECYT (1110219) Proyecto 2011-2014 Inv. Responsable
FORTALECIMIENTO Y CONSOLIDACIÓN DE LAS COMPETENCIAS ACADÉMICAS E INVESTIGACIÓN CIENTÍFICA EN EL ÁREA ACUÍCOLA ASOCIADA AL DEPARTAMENTO DE CIENCIAS BIOLÓGICAS DE LA UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO A TRAVEZ DE LA INSERCIÓN DE 2 INVESTIGADORES DE EXCELENCIA. PAI (79090006) Proyecto 2010-2013 Inv. Principal
Estudio de las concentraciones mínimas inhibitoria y susceptibilidad in vitro de florfenicol, oxitetraciclina y acido oxolínico en cepas de patógenos prevalentes de salmónidos, con el fin de estandarizar la selección de tratamientos terapéuticos Proyecto Interno Universidad Andrés Bello DI-01-10/R (DI-01-10/R) Proyecto 2009-2010 Inv. Principal
ESTUDIOS IN VITRO E IN VIVO DE FACTORES DE PATOGENICIDAD EN EL PATOGENO DE SALMON DEL ATLANTICO (SALMO SALAR) STREPTOCOCCUS PHOCAE. FONDECYT (1090054) Proyecto 2009-2011 Inv. Responsable
Investigación, desarrollo y producción de vacunas para la prevención de la Pisciricketsiosis y enfermedades infecciosas concomitantes en Salmo salar Proyecto INNOVA Código Nº 207-6537 (207-6537) Proyecto 2008-2008 Coinvestigador(a)
DESARROLLO Y PRODUCCIÓN DE VACUNAS CON REGISTRO SANITARIO PARA PECES, INDICADAS PARA PREVENIR LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS PRODUCIDAS POR PATÓGENOS EMERGENTES ACLIMATADOS EN CHILE PAI (IPC19) Proyecto 2006-2009 Inv. Principal
Estudios in vitro e in vivo de importantes factores de virulencia en los patógenos de peces marinos Pseudomonas anguilliseptica y Tenacibaculum maritimum Ministerio de Ciencia y Tecnología, España. Participación=> Miembro del Equipo de Investigación del Proyecto. Universidad de Santiago de Compostela, España (AGL2004-07037) Proyecto 2004-2006 Coinvestigador(a)
DESARROLLO DE PRODUCTOS DE ORIGEN MICROBIANO PARA EL CONTROL DEL BIOFOULING EN LA INDUSTRIA ACUÍCOLA. FONDEF (D01I1166) Proyecto 2001-2002 Investigador(a)
INVESTIGACIÓN Y DESARROLLO DE TECNOLOGÍA PARA LA UTILIZACIÓN DE PROBIÓTICOS EN EL CULTIVO DEL OSTIÓN DEL NORTE (Argopecten purpuratus) FONDEF (D97I2033) Proyecto 1997-2000 Tesista
OPTIMIZACIÓN DE LA PRODUCCIÓN DE SEMILLAS DE INVERTEBRADOS MARINOS DE IMPORTANCIA COMERCIAL MEDIANTE LA UTILIZACIÓN DE BIOPELÍCULAS MICROBIANAS FONDEF (D00I1168) Proyecto 1940-1940 Investigador(a)


Interacción bacteria-microalga en el ambiente marino y uso potencial en acuicultura Riquelme, Carlos E.; AVENDAÑO-HERRERA, RUBÉN E. Review SCIELO Revista chilena de historia natural (2003)
Microalgae and bacteria interaction in the aquatic environment and their potential use in aquaculture Riquelme, CE; Avendano-Herrera, RE Review ISI Revista chilena de historia natural (2003)

187

Ruben Avendaño

Full Professor

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

Viña del Mar, Chile

Matías Poblete

Head of Microbiology Development

R&D

Veterquimica S.a

Santiago, Chile

Alejandro Yanez

Full professor

Faculty of Science

UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Valdivia, Chile

Marcos Godoy

Director de Investigacion

Universidad San Sebastian

Puerto Montt, Chile

Jaime Figueroa

Profesor Titular

Bioquimica y Microbiologia

UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Valdivia, Chile

Juan Carcamo

Profesor Titular

Instituto de Bioquímica y Microbiología

Universidad Austral de Chile

Valdivia, Chile

Pedro ILARDI

Encargado de Proyectos de Investigación y Desarrollo

Investigación y Desaarollo

Farmacología en Aquacultura Veterinaria FAV S.A.

Santiago , Chile

Pamela Ruiz

Investigador

Centro de Biotecnología

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

Cristian Oliver

Investigador asociado a Proyecto

UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Chile

Héctor Levipan

Profesor Asociado

Ciencias y Geografía

Universidad de Playa Ancha de Ciencias de la Educación

VALPARAISO, Chile

Patricio Sánchez

Asistente de Investigación

Departamento de Biología

Centro de Estudios Científicos

Valdivia, Chile

Mauricio Hernandez

Chief Laboratory Officer

Proteogenomica

MELISA Institute

San Pedro de la Paz, Chile

Monica Saldarriaga

Investigadora

Vicerrectoría de Vinculación con el medio e investigación

Universidad Bernardo O'Higgins

Santiago, Chile

Jorn Bethke

CTO

AQUIT

Viña del mar, Chile

Alex Romero

Profesor Asociado

Facultad de Ciencias Veterinarias

UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Valdivia, Chile

Derie Fuentes

Director

Center For Systems Biotechnology

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

Carlos Riquelme

Director Centro de Bioinnovacion

UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA

Antofagasta, Chile

Juan Pontigo

Academico-Investigador

Medicina Veterinaria

Universidad San Sebastián

Puerto Montt, Chile

Juan Valdés

Head lab

Ciencias Biologicas

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

Santiago, Chile

Alfredo Molina

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

SANTIAGO, Chile

Jorge Fernandez

JEFE SUBDEPTO

BIOMEDICO NACIONAL Y DE REFERENCIA

INSTITUTO DE SALUD PUBLICA

santiago, Chile

Luis Vargas

Full Professor

Universidad Austral de Chile

Valdivia, Chile

Hugo Silva

Asistente Científico

Cargill Innovation Centre

Cargill

Calbuco, Chile

María Rojas

Profesor adjunto

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

Ariel Reyes

Director de Departamento

Ciencias Biológicas

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

Santiago, Chile

Iván Valdés

Investigador

Investigación y desarrollo

Veterquímica S. A.

Santiago, Chile

Adolfo Isla

Asistente de investigacion Proyecto FONDAP-INCAR

Facultad de Ciencias

Universidad Austral de Chile

Valdivia, Chile

Nelson Reyes

Antofagasta, Chile

Fernando Mardones

Profesor Asistente

Medicina

Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

María Rauch

ACADEMICO

INSTITUTO DE BIOQUÍMICA Y MICROBIOLOGIA

UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Valdivia, Chile

Julio Retamales

LUIS MERCADO

Profesor Titular

Instituto de Biología

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

Denise Haussmann

Profesora Titular

Departamento de Ciencias Básicas

Universidad Santo Tomás

Valdivia, Chile

Ricardo Oyarzun

Investigador, apoyo en investigación científica

Instituto de Ciencias Marinas y Limnológicas

Universidad Austral de Chile

Valdivia, Chile

Julio Retamales

Profesor Investigador

Facultad de Medicina Veterinaria y Agronomía

Universidad d elas Américas

Viña del Mar, Chile

RENE MANRIQUEZ

Investigador Asociado

Universidad de Atacama

COPIAPO, Chile

Carmen Feijóo

Profesor asociado

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

Juan Manuel Estrada

Director

Facultad de Ecología y Recursos Naturales

Universidad Andrés Bello

Quintay , Chile

Jaime Romero

Profeasor Asociado

INTA

Universidad de Chile

Santiago, Chile

Fanny Guzman

Investigador Senior

Núcleo de Biotecnología Curauma

Pontificia Universidad Católica de Valparaiso

Valparaiso, Chile

Fernando Silva

Academico asociado y Jefe de carrera Biotecnología e Ingeniería en Biotecnología

Biotecnología

Universidad de Antofagasta

Antofagasta, Chile

Sergio Marshall

PROFESSOR

BIOLOGY INSTITUTE

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

Marcos Cortés

Tecnico

Instituto de Bioquímica y Microbiología

UACh/Veterquímica

Valdivia, Chile

José Muñoz

investigador, academico

CENTRO I-MAR, UNIVERSIDAD DE LOS LAGOS

Puerto Montt, Chile

Claudio Cordova

Investigador asistente

Medicina

Universidad de Valparaíso

Valparaíso, Chile

VICTOR OLAVARRIA

PROFESOR ASOCIADO

BIOQUMICA Y MICROBIOLOGIA

Universidad Austral de Chile

valdivia, Chile

Claudio Alvarez

Investigador Titular

Laboratorio FIGEMA

Centro de Estudios Avanzados en Zonas Aridas

Coquimbo, Chile

Claudio Alvarez

Profesor Asistente

Acuicultura

Universidad Católica del Norte

Coquimbo, Chile

Camila Solís

Docente Hora / Investigador Lab. Inmunología en Peces

Biología

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

Jorge Aedo

Profesor Auxiliar

Biología y Química

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

Marcelo Cortez

Académico

Biología

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

Jaime Romero

Profesor Asociado

Alimentos

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

Sharin Valdivia

Profesor Adjunto Adhonorem

Facultad de Ciencias

Universidad Austral de Chile

Valdivia, Chile

Sara Valdés

Jefe de Laboratorio I+D

Laboratorio de I+D

Farmacología en Aquacultura Veterinaria FAV

Puerto Varas, Chile

Jaime Tobar

CEO

Kreas Inc

Santiago, Chile

Paola Olmos

Jefe de Laboratorio

Vicerrectoría de Investigación y Doctorados

Universidad San Sebastián

Puerto Montt, Chile

Claudio Miranda

Profesor Titular

Departamento de Acuicultura

UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL NORTE

Coquimbo, Chile

Diego Valenzuela

PostDoc

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

Marcos Mancilla

Director Cientifico

Investigación y desarrollo

ADL Diagnostic Chile Ltda

Puerto Montt, Chile

Carlos Bustos

Profesor Titular

Química

INSTITUTO DE CIENCIAS QUÍMICAS, FACULTAD DE CIENCIAS, UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Valdivia, Chile

pamela araya

JEFE DE SECCIÓN

BIOMEDICO

INSTITUTO DE SALUD PUBLICA DE CHILE

SANTIAGO, Chile

Ruben Esteban Avendaño Herrera

Líneas de Investigación

Educación

Aquaculture engineer, UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA. Chile, 1997

Bachelor Marine science, UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA. Chile, 1997

PhD Biology, Universidad de Santiago de Compostela. España, 2005

Master Diploma de Estudios Avanzados, UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA. España, 2004

Post Graduado Biología, UNIVERSIDAD ANDRES BELLO. Chile, 2012

Experiencia Académica

Full Professor Full Time

Associate Professor Full Time

Experiencia Profesional

Main Researcher in Fish Pathology Laboratory Full Time

Microscopy expert Part Time

Team member, participation and grant elaboration MECESUP Part Time

Responsible, training team in the Microsoft Program Part Time

In charge of environmental impact study, Antofagasta port(SILOB-CHILE) Full Time

Formación de Capital Humano

Premios y Distinciones

Profesor Honorario, Universidad Nacional de Tumbes, Perú. Resolución No. 0417-2013/UNIT-CU.

Director del Grupo de Estudio (GE) de Salud y Producción Animal de FONDECYT.

Secretario Sociedad Chilena de Acuicultura

Advisor Working Group on Aquatic Animals and Clinical and Laboratory Standard Institute (CLSI).

Miembro del Comité de Experto del Servicio Nacional de Pesca para Piscirickettsia salmonis.

Premio Extraordinario de Doctorado, Universidad de Santiago de Compostela. Reconocimiento a la mejor tesis de doctorado de la Facultad de Biología año 2006.

Primer lugar en la promoción de estudiante de la carrera de Ingeniería de Acuicultura de la Universidad de Antofagasta.

Beca "Apoyo a la participación de estudiantes de doctorado en congresos nacionales y sociedades cientificas"

Beca

Beca Sociedad Española de Microbiologia

Beca: Oficina de Investigación y Tecnología, Universidad de Santiago de Compostela

Beca CONICYT-BID

Miembro del consejo editorial da Journal of Fish Diseases

Portada Bulletin of the European Association of Fish Pathologists

Portada de Journal of Fish Diseases

Reconocimiento como mejor investigador del año

Reconocimiento como mejor investigador del año

Reconocimiento como mejor investigador del año

Miembro Comité becas CONICYT - Ciencias Veterinarias

Miembro INN

Miembro comité CCTA

Evaluador CORFO

Miembro comité de Formación de Personal Avanzado - CONICYT

Acreditador CNA

Miembro Comité de Pesca y Acuicultura de FONDEF

Miembro de GE - FONDECYT

Miembro Comision doctorado e Biotecnología

Article (170)