Artificial Intelligence, Epistemology, Symbolic Machine Learning, Optimisation, Artificial Evolution, Quantum Computing, E-education

Tesis de doctorado dirigidas (en curso)

Tam'si Ley (01/11/2021, 50% avec Johannes Schachenmayer) "Resource estimation for practical quantum computing"
Lalla-Aïcha Koné (01/11/2020, 75% avec Ahmedou Haouba) "Aide à la décision à partir de motifs extraits de données massives pour l’amélioration du service public"
Yohan Solon (15/11/2020, 75% avec Ecaterina Pacurar) "Efficacité de l'inter-tutorat en contexte d'une pédagogie de masse personnalisée"
Marc Haegelin (28/02/2020, 50% avec Christian Rolando) "Algorithmes massivement parallèles pour la spectrométrie de masse et la protéomique"

Tesis de doctorado dirigidas (finalizadas)

Hiba Khodji (01/11/2020 avec Julie Thompson, encadrement Anne Jeannin-Girardon) "Caractérisation de la transférabilité des représentations latentes des réseaux neuronaux profonds pour la détection d’erreurs dans la prédiction de séquences de gènes" soutenue à l'Université de Strasbourg le 7 novembre 2023
Corentin Meyer (01/10/2020, 50% avec Olivier Poch) « MYO-xIA : IA explicable pour la classification intégrée et la prédiction des myopathies congénitales » Projet Artic, soutenue à l'Université de Strasbourg le 20 octobre 2023
Romain Orhand (Oct 2018 - Nov 2022), 50% avec Pierre Parrend) "Développement d'ordinateurs autonomes combinant évolution artificielle et intelligence artificielle", soutenue à Strasbourg le 10 novembre 2022
Anne Jeannin-Girardon (thèse d'HDR) "Vers une Intelligence Artificielle Autonome, Explicable et Éthique : alliance entre approches ontologiques et législatives", soutenenue à Strasbourg le 9 novembre 2022
Anna Ouskova (Août 2018 - Mai 2022, 50% avec Pierre Parrend) "Optimisation évolutionnaire de systèmes de réfrigération magnétique utilisant des alliages magnétocaloriques" soutenue à Strasbourg le 24/05/2022.
Nicolas Scalzitti (Oct 19 - Sept 21) "Nouvelle stratégie d'annotation des génomes par l'utilisation d'algorithmes d'intelligence artificielle" (co-dirigée à 50% avec Julie Thompson), thèse de l'Université de Strasbourg en partie financée par fondation Bioniria, soutenue le 29 septembre 2021 à l'Université de Strasbourg.
Ulviya Abdulkarimova (Oct 18 - Sept 21) "Sinus-it: an Evolutionary Approach to Harmonic Analysis", (50% avec Christian Rolando), thèse de l'Université de Strasbourg en collaboration avec l'Université de Lille et l'Université Franco-Aserbaïdjanaise (UFAZ) soutenue le 2 septembre 2021 en visioconférence.
Salma Mesmoudi (HDR, Dec 2020) "Résolution de problèmes et intégration de données multi-échelle et multi-source : approche géométrique et dynamiques complexes"
Fabio Guigou (Dec 14 - Juin 19) "The Artificial Immune Ecosystem: a scalable immune-inspired active classifier", co-encadrant : Pierre Parrend, thèse de l'Université de Strasbourg soutenue le 18 juin 2019 à l'Université de Strasbourg
Pierre Parrend (HDR, décembre 2017) Emergent Industrial Ecosystems, Habilitation à Diriger des Recherches de l'Université de Strasbourg soutenue le 12 décembre 2017 à l'ECAM, Strasbourg
Pierre Masai (Oct 14 - Sept 17) "Modeling the lean organization as a complex system", thèse de l'Université de Strasbourg soutenue le 29 septembre 2017 à l'Université de Strasbourg
Igor Santos Peretta (oct 12 - sept 15) Evolution of an integrated model for a complex system through massively parallel Genetic Programming, en co-direction avec Keiji Yamanaka, thèse de l'Université de Strasbourg en co-tutelle avec l'université d'Uberlandia soutenue le 19 septembre 2015 à l'Université d'Uberlandia, Brésil.
Cécilia Zanni-Merk (HDR 11/13 - 11/14 thèse d'Habilitation à Diriger les Recherches) "Knowledge Technologies for Problem Solving in Engineering", garant : Pierre Collet, soutenue le 20 novembre 2014 à l'Université de Strasbourg
Stéphane Querry (09/10 - 09/14) Control and modelling of autonomous aircrafts by evolutionary computing, thèse confidentielle Polyvionics, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 29 septembre 2014 à l'Université de Strasbourg
Wei Yan, (09/10 - 02/14)Modélisation de (Méta)Connaissances pour la Conception Inventive, en co-direction avec Denis Cavallucci, LGeCo, co-encadrée par Cécilia Zanni-Merk. soutenue le 7 février 2014 à l'INSA de Strasbourg
Frédéric Krüger (10/11 - 02/14), Determination of end user power load profiles by parallel evolutionary computing, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 17 février 2014 à Électricité de Strasbourg
Nicolas Lachiche (12/10 - 12/11 thèse d'Habilitation à Diriger des Recherches), Relational data mining guided by needs, Garant : Pierre Collet, soutenue le 5 décembre 2011 à l'Université de Strasbourg
Ogier Maitre (10/08 - 09/11), GPGPU for Evolutionary Algorithms, sous la direction de Pierre Collet, soutenue le 30 septembre 2011 à l'Université de Strasbourg
Olivier Kühn (10/07 - 10/10), Methodology for Knowledge-Based Engineering Template Update - Focus on Decision Support and Instances Update, en co-direction avec Parisa Ghodous, thèse financée par la Société Prostep, soutenue le 22 octobre 2010 à l'Université de Strasbourg
Grégory Valigiani, Développement d'un paradigme d'optimisation par Hommilière et application à l'enseignement par internet, Université du Littoral Côte d'Opale, thèse financée par la société Paraschool, sous la direction de Pierre Collet, soutenue en novembre 2006.
Claire Bourgeois-République, Plateforme de réglage automatique et adaptatif d'implant cochléaire par algorithme évolutionnaire interactif, Université de Bourgogne encadrée par Pierre Collet décembre 2004.
Yann Landrin-Schweitzer, Algorithmes génétiques interactifs pour le text-retrieval, thèse de l'Université d'Orsay dirigée par Evelyne Lutton, co-encadrée par Pierre Collet, soutenue en septembre 2003.

Presidente de jurados de tesis

Xin NI, Inventive Solutions Retrieval from Patent Documents via Natural Language Processing, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Denis Cavallucci, co-encadrée par Ahmed Samet, soutenue le 18 décembre 2021.
Yann hodé, Contribution à l'interprétation d'images et vérification de la consistance d'un graph, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Aline Deruyver, soutenue le 12 novembre 2018.
Karim el Soufi, Study of circular code motifs in nucleic acid sequences, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Christian Michel, soutenue le 24 janvier 2017
Amir Jaberzadeh, "Simulation of heat transfer and automatic optimization of multiple probes trajectories for pre-operative planning of percutaneous thermoablation interventions", thèse en Informatique de l'Université de Strasbourg, dirigée par Caroline Essert, soutenue le 13 février 2015.
Idriss Aberkane, Ballade de la Conscience entre Orient et Occident : une perspective soufie sur la conscience occidentale, connectant The Kasidah de R. F. Burton et The Waste Land de T. S. Eliot, Thèse en Études Méditerranéennes et Littérature Comparée de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy et Patrick Laude, soutenue le 16 juin 2014.
Jonathan Fréchard, Systèmes d'entraînement de bandes flexibles : optimisation multicritère des performances dynamiques par approche évolutionnaire, Thèse en automatique de l'Université de Strasbourg (INSA) dirigée par Dominique Knittel, soutenue le 2 juillet 2013.
Alexis Bultey, Représentation hybride des heuristiques et méta-heuristiques utilisées pour la conception innovante, INSA de Strasbourg, juin 2009.
Camélia Ignat, Improving Statistical Alignment and Translation Using Highly Multilingual Corpora, INSA de Strabourg, juin 2009.
Arnaud Quirin, "Images de télédétection Images hyperspectrales Intelligence artificielle Règles de classification Systèmes de classifieurs", thèse de l'Université Louis Pasteur dirigée par Jerzy Korczak et Massimo Menenti, soutenue en décembre 2005.
En tant que rapporteur :
Marwa BEN M’BAREK, Détection de communautés dans les grands réseaux : Application aux réseaux d'interactions de gènes, Thèse en informatique de l'Université PSL Paris Dauphine, en cotutelle avec l'Université de Tunis El Manar, soutenue à Paris le 14 octobre 2022.
Ahmed Hadj Said, Intégration du stockage dans les méthodes de planification des réseaux électriques basse tension, Thèse en informatique de l'Université Grenoble-Alpes, soutenue le 31 janvier 2018.
Idriss Aberkane, "Mind Ergonomy for the Knowledge Economy", Thèse en Gestion de l'Université Paris Saclay Ecole Polytechnique, dirigée par Pierre-Jean Benghozi et Paul Bourgine, soutenue le 3 février 2016.
Meysam Hashemi, "Modélisation mathématique et simulation numérique de populations neuronales thalamo-corticales dans le contexte de l'anesthésie générale", Thèse en informatique de l'Université de Lorraine, dirigée par Axel Hutt, soutenue le 14 janvier 2016.
Abdelhamid Zouhair, "Raisonnement à Partir de Cas Dynamique Multi-agent - Application à un Système de Tuteur Intelligent", Thèse en informatique en cotutelle de l'Université du Havre (co-direction Cyrille Bertelle) et de l'Université Abelmalek Essaâdi (Maroc, co-direction Benaissa Amami), soutenue le 20 octobre 2014.
Messaouda Mechelfekh, "L’islam spirituel contemporain au travers d’Internet : interactions, modélisation et prospective", Thèse de doctorat en Langues et littératures étrangères de l'Université de Strasbourg, dirigée par Eric Geoffroy soutenue le 11 septembre 2014.
Gilian Basso, Approche à base d’agents pour l’ingeniérie et le contrôle de micro-réseaux, Thèse en Informatique de l'Université de Technologie Belfort-Montbéliard, dirigée par Vincent Hilaire, soutenue le 9 décembre 2013.
Mathieu Chouchane, Optimisation spatio-temporelle d’efforts de recherche pour cibles manoeuvrantes et intelligentes, Thèse en Informatique de l'Université d'Aix-Marseille, dirigée par Mustapha Ouladsine et encadrée par Sébastien Paris et François le Gland, soutenue le 17 octobre 2013.
Manuel Clergue, Paysages et Dynamiques : contributions à l'évolution artificielle, Thèse d'Habilitation à Diriger des Recherches de l'Université des Antilles et de la Guyane, soutenue le 7 décembre 2011.
Sébastien Derivaux, Construction et classification d'objets à partir d'images de télédétection par une approche itérative guidée par des connaissances du domaine, Université de Strasbourg, avril 2009. Rapporteur : Renaud Barate, « Apprentissage de fonctions visuelles pour un robot mobile par programmation génétique, » Ecole Nationale Supérieur de Techniques Avancées, novembre 2009.
Laura Diosan, Exploring Hybrid Approaches based on Evolutionary Algorithms, INSA de Rouen, octobre 2008.
Amir Nakib, Conception de méta-heuristiques d'optimisation pour la segmentation automatique d'images. Application à des images biomédicales, Université Paris 12, décembre 2007.
Dalibor Fiala, 'Web Mining Methods for the Detection of Authoritative Sources, Université Louis Pasteur, Strasbourg, novembre 2007.
Salma Mesmoudi, Conception d'un système informatique mimétique pour résoudre le problème du voyageur de commerce : Application à la cartographie physique du génome, Université de Tanger, Novembre 2005.

Examinador de jurados de tesis

Aymen Sellaouti, Méthode collaborative de segmentation et classification d'objets à partir d'images de télédétection à très haute résolution spatiale, thèse en informatique de l'Université de Strasbourg en co-tutelle avec l'Université de Tunis, dirigée par Aline Deruyver et Khaled Bsaïes, soutenue le 16 septembre 2014.
Lhassane Idoumghar, Métaheuristiques Hybrides et Leurs Applications, Thèse d'Habilitation à Diriger des Recherches en informatique, de l'Université de Haute Alsace, soutenue le 12 novembre 2012.
Jean-Noël Martin, No Free Lunch et recherche de solutions structurantes en coloration, Thèse en informatique de l'Université Technologique de Belfort-Montbéliard, dirigée par Alexandre Caminada, soutenue le 9 décembre 2010.
Olivier Pauplin, Adaptation de l'algorithme des mouches à un environnement dynamique réel, Université Paris V, septembre 2007.
Kamel Slimani, Système d'échange et de partage de connaissances pour l'aide à la conception collaborative, Université Lyon I, septembre 2006.
Amine Boumaza, Application de l'Algorithme des Mouches à la trajectoire de robots virtuels, Université d'Orsay, Mai 2004.
Emmanuel Sapin, Recherche par algorithmes évolutionnaires d'automates cellulaires universels, Univ. de Bourgogne, décembre 2003.
Philippe Guermeur, Vision robotique monoculaire : reconstruction du temps avant collision et de l'orientation des surfaces à partir de l'analyse de la déformation, Université de Rouen, octobre 2002.
Bogdan Stanciulescu, Identification de modèles physiques d'animation par évolution artificielle, Université Joseph Fourier de Grenoble, mai 2002.
Olivier Roux, Mémoire dans les algorithmes à colonie de fourmis, Université du Littoral, décembre 2001.

Supervisión de posdoctorados

Alejandro Rinçon Lopez, "Portage de la plateforme EASEA sur le Cloud", projet ANR EASEA-CLOUD, juin 2014 - mars 2015
Carlos Catania, Optimisation d'une flotte de véhicules médicaux, Fev 2014 - Fev 2015, pour la société Synovo
Waldo Cancino, Portage de la plate-forme EASEA-CLOUD sur la grille, Oct. 2012 - Oct 2013, projet ANR EASEA-CLOUD
Lidia Yamamoto, Artificial Chemistries on GPGPU, Avril 2010 - Avril 2011, financement Région Alsace
Deepak Sharma, Projet Administrateur Réseau Artificiel (ARA), société Kelerio, Mai 2009 - Mai 2010
Pierrick Legrand, "Projet RNTS HÉVÉA : Étude et Valorisation de l'Écologie Auditive", Sept 2005 - Sept 2006

Tesis de magíster dirigidas (finalizadas)

Léo Chéneau, Super-Resolution of frequential spectrums by Artificial Intelligence, 2023
Seyid Alibayli, Analysis of infrared spectra (FT-IR) using TensorFlow, 2023
Shamil Ahmadov, Applications of Differential Evolution to Harmonic Analysis, 2023
Kanan Jafarli, Applications of EA in climate projections, 2022
Sanan Yusibov, Harmonic analysis applied to mass spectrometry, 2022
Quentin Christoffel, "Détection de l'incertitude d'un modèle d'intelligence artificielle", février 2021 - juillet 2021
Thomas Chabin, "Visualisation Scientifique d'algorithmes évolutionnaires distribués", projet ANR EASEA-CLOUD, mars 2014 - mars 2015
Frédéric Krüger, Recherche de zéolithes par évolution artificielle, M2 Recherche, mars - sept 2011
Farzad Sehat, Gestion de portefeuilles financiers par évolution artificielle, M2 Recherche, mars - sept. 2011
Arijit Biswas, thèse de l'IIT Kharagpur sur l'optimisation du processus d'extraction de Manganèse de nodules polymétalliques extraits de fonds sous-marins, dirigée par le Professeur Nirupam Chakraborty, avr. 09 - déc. 09
Ariel Tchougang, Etude du Context-Aware Crossover en Programmation Génétique, M2 Recherche, mars 08 - sept 08

Chairman de Complex Computational Ecosystems CCE'23 à Baku, Azerbaidjan
Co-organisation de la conférence internationale EA'2017 à Paris.
Co-organisation du satellite Territorial Intelligence for Multi-level Equity and Sustainability de la Conference on Complex Systems 2016 à Amsterdam.
CS-DC'15 : Président du Comité d'Organisation de la première e-conférence mondiale sur les Systèmes Complexes, sept-oct 2015, Phoenix, Arizona.
Bioinformatics Europe 2015 London : Animateur de la table ronde Large scale computing tasks using cloud and mobile resources.
Co-chair avec Man Leung Wong du track Parallel Evolutionary Systems de la conférence GECCO'11 à Dublin.
Guest Editor avec Man Leung Wong d'un numéro spécial du journal international Springer Genetic Programming and Evolvable Machines intitulé Evolutionary Algorithms for Data Mining, à paraître (cf. cfp).
Chairman de la session Evolutionary Multiobjective Optimization de la conférence GECCO'10 à Portland.
Animation du tutoriel Evolutionary Computation on GPUs avec Wolfgang Banzhaf et Simon Harding de la conférence GECCO'10 à Portland.
EA'09 : Président de la 9ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle, oct 2009, Strasbourg.
Conférencier invité de la conférence Algorytmy Ewolucyjne i Optymalizacja Globalna'09 à Zawoja, Pologne.
Co-organisateur de la 8ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle (EA'07) à Tours, octobre 2007.
Organisateur de la deuxième école d'été sur l'Evolution Artificielle à Yravals en mai 2007.
Chairman, avec Valentin Masero du track Computer Applications in Health Care (CAHC'07) du 22ème; Symposium on Applied Computing de l'ACM (SAC'07) à Séoul (Corée du sud), mars 2007.
Organisateur de la première école d'été sur l'Evolution Artificielle à Yravals en juin 2006.
Programme Chair, avec Marco Tomassini de la 9ème conférence internationale sur la programmation génétique EURO-GP'06 à Budapest (Hongrie).
Chairman, avec Valentin Masero du track Computer Applications in Health Care (CAHC'06) du 21è Symposium on Applied Computing de l'ACM (SAC'06) à Dijon (France).
Co-organisateur des Conférences Internationales EA'05 (Lille) et EA'03 (Marseille).
Publication Chair de la 8è conférence internationale sur la programmation génétique EURO-GP'05 à Lausanne (Suisse).
Président de la 5ème Conférence Internationale sur l'Evolution Artificielle (EA'01) au Creusot (France).
Co-organisateur des JETs (Journées Évolutionnaires Trimestrielles) 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17.