Bioinformática, Genómica y Transcriptómica

Mi carrera científica comenzó con mis estudios de pregrado en Ingeniería Bioinformática, carrera con un fuerte componente de investigación en las áreas de proteómica, genómica y diseño de fármacos. Posteriormente me incorporé al Centro de Genómica y Bioinformática de la Universidad Mayor como asistente de investigación, donde acabé encantado por la genómica y decidí hacer mi doctorado en Genómica Integrativa en la misma universidad. Al ingresar en este programa, se reconoció mi perfil y antecedentes curriculares otorgandome una beca completa de arancel y mantención por los 4 años de duración del programa. Durante el desarrollo de mi doctorado, tuve la oportunidad de colaborar con varios grupos de investigación publicando excelentes artículos y aprendiendo diversas metodologías bioinformáticas para el análisis de secuencias biológicas. Además, tuve la oportunidad de ayudar en la parte práctica de los dos cursos de Bioinformática de mi programa de doctorado durante los años 2015 y 2016. Esto me permitió ayudar en la formación en bioinformática de los futuros doctores en genómica integrativa. El año 2016, tuve la oportunidad de participar en el congreso ISCB Latin america 2016 en donde el trabajo presentado obtuvo el premio en tercer lugar a los mejores posters. Luego, en el año 2017, como retribución de mi beca de doctorado, participé como profesor de laboratorio en los cursos de pregrado de Bioinformática; y Taller Integrativo en Genómica y Bioinformática de la carrera de Biotecnología de la Universidad Mayor. El año 2019 fui invitado a participar como profesor del módulo de Introducción a las ciencias Ómicas en el diplomado de Bioinformática y Biología Computacional de la Universidad de Chile. Además, durante el primer semestre del 2020 fui invitado nuevamente al mismo programa, pero este año dicté clases en el módulo de Python y en el módulo de Metagenómica. Esta fue una tarea muy desafiante ya que tuve que enseñar un lenguaje de programación a profesionales del área de salud. Finalmente, el primer semestre de este año fui profesor de cátedra en el ramo de Estadística aplicada con R en la carrera de Bioquímica en la Universidad de Chile.

En el año 2018 tuve la oportunidad de participar como docente en la escuela de verano en Salud Pública organizada por la Universidad de la Frontera. El curso que dictamos se llamaba Bioinformática aplicada a la Salud Pública (t.ly/0yet), en donde presentamos de manera amigable y cercana diversas metodologías utilizadas en bioinformática que se aplican o se pueden aplicar en la salud pública. Durante el curso, tuve la oportunidad de compartir con los funcionarios del área de la salud mis conocimientos en bioinformática y que ellos lograran aprender las aplicaciones que estos tenían en sus diversas áreas de desarrollo. Esto me motivó a siempre considerar el disponibilizar, no solo para la comunidad científica, si no que también para todo público, herramientas y bases de datos bioinformáticas. El reciente año, en colaboración con un grupo de la Universidad de Sao Paulo logramos disponibilizar una herramienta de trazabilidad de casos de COVID-19, que también puede ser usada para cualquier tipo de dato que tenga una localización georeferenciada y una fecha asociada. Esta herramienta fue muy comentada en diversos medios de comunicación digitales como TVN (t.ly/MXdS), La Tercera (t.ly/Fj2v) y Cooperativa (t.ly/CIRa). Por último, dentro del marco de este proyecto, no se descarta la creación de una página web que presente de manera amigable tanto los datos epidemiológicos y biológicos que relacionan la insuficiencia cardiaca y los distintos tipos de cáncer, para que cualquier usuario pueda entender de manera fácil los riesgos asociados a cada una de estas enfermedades.