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Sara Cuadros Orellana

Profesor Titular

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

Líneas de Investigación


Microbial Genomics and Metagenomics Microbial Ecology and Evolution Applied Microbiology Biotechnology

Educación

  •  Food Science / Microbiology, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS. Brasil, 2004
  •  Genetics, UNIVERSIDADE DE SAO PAULO. Brasil, 1999
  •  Biological Sciences, UNIVERSIDADE DE SAO PAULO. Brasil, 1996

Experiencia Académica

  •   Postdoctoral Associate Full Time

    UNIVERSIDAD MIGUEL HERNANDEZ

    Departamento de Producción Vegetal y Microbiología

    Alicante, España

    2006 - 2006

  •   Profesor Titular Full Time

    Universidade Tiradentes

    Biotecnología

    Aracaju (Brasil), Chile

    2006 - 2009

  •   Profesor Adjunto Full Time

    Universidade Federal do Pará

    Instituto de Ciencias Biológicas

    Belém, Brasil

    2009 - 2010

  •   Investigador (Proyecto) Full Time

    FUNDACAO OSWALDO CRUZ

    Belo Horizonte (Brasil), Brasil

    2010 - 2017

  •   Profesor Titular Full Time

    UNIVERSIDAD CATOLICA DEL MAULE

    Ciencias Agrarias y Forestales

    Talca, Chile

    2017 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   Investigador Full Time

    Oswaldo Cruz Foundation (Fiocruz)

    Belo Horizonte, Brasil

    2010 - 2017

  •   Profesor Adjunto Full Time

    Universidade Federal do Pará (UFPA)

    Belem, Brasil

    2009 - 2010

  •   Profesor Titular Full Time

    Universidade Tiradentes (UNIT)

    Aracaju, Brasil

    2006 - 2009

  •   Review Editor Other

    Frontiers in Microbiology

    Lausanne, Suiza

    2020 - A la fecha

  •   Miembro del Grupo de Estudio Biología 3 Other

    Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo de Chile (ANID)

    Santiago, Chile

    2021 - A la fecha

  •   Experto Evaluador Other

    Agencia Estatal de Investigación (AEI)

    Madrid, España

    2020 - A la fecha

  •   Profesor Titular Full Time

    Universidad Católica del Maule

    Talca, Chile

    2019 - A la fecha

  •   Profesor Adjunto Full Time

    Universidad Católica del Maule

    Talca, Chile

    2017 - 2019

  •   Miembro del Consejo Científico Part Time

    Fundação de Apoio à Pesquisa e a Inovação Tecnológica do Estado de Sergipe (FAPITEC)

    Aracaju, Brasil

    2007 - 2009

  •   Miembro Other

    Comité de Ética Científico de la Universidad Católica del Maule

    Talca, Chile

    2018 - 2020

Formación de Capital Humano


I - Organization of Training courses:

2016: Main organizer. “Principles and Trends in Genomics and Computational Biology”. International Course, E-Learning/MOOC (30h). Funded by the Institut Pasteur International Network, with a EURO 9,000 grant. https://moocs.pasteur.fr/courses/course-v1:Fiocruz_Institut_Pasteur+01+02/about

2015: Main organizer. “Principles and Methods for the study of Microbiomes”. Curso internacional (80h). Funded by the Brazilian-Argentinian Center for Biotechnology (CBAB/CABBIO), with a BRL 70,000 grant.

2015: Co-organizer. “Metagenomics Course”. International Course (40h). Funded by the Oswaldo Cruz Foundation (FIOCRUZ) with a BRL 15,000 grant.

2014: Main organizer. “Metagenomics Workshop”. International Meeting (40h). Funded by CAPES (BRL 22,000 grant) and CNPq (BRL 15,000 grant).

2009: Co-organizer. “Next-Gen Bioinformatics: Assembly and Annotation of Bacterial Genomes”. National Course (40h), funded by the Para Network of Genomics and Proteomics.

2008: Main organizer. “Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental”. International Meeting (32h). Funded by CAPES (BRL 15,000 grant) and CNPq (BRL 15,000 grant).

II - Contribution to Training courses:

“Reconstrucción de genomas a partir de metagenomas - retos metodológicos”. Curso Virtual "Metagenomas de Ambientes Extremos: Caracterización de la Biodiversidad y Prospección de Aplicaciones Biotecnológicas". Universidad Autónoma de Santo Domingo, República Dominicana, 2020.

“Estudio de microbiomas en ambientes extremos: desafíos y oportunidades”. Centro Argentino-Brasileño de Biotecnología. Mar del Plata, Argentina, 2020.

"Biodiversidad microbiana desde un punto de vista Bioinformático". Universidad Austral de Chile / Universidad de Santiago de Chile. Puerto Montt, Chile, 2020.

III - Postdoctoral Fellow Supervision:

Aparna Banerjee – Characterization of exopolysaccharides from thermophilic and halophilic microorganisms. VRIP/UCM.

IV - Graduate Students Supervision

PhD Thesis:

Ubiana de Cássia Silva. "Diversidade e mecanismos de promoção de crescimento de milho por endofíticos e rizobactérias sob deficiência de fósforo utilizando ferramentas de metagenômica e de transcriptômica". PhD Program in Microbiology, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil, 2018.

Julliane Dutra Medeiros. "Estudo de comunidades microbianas associadas a drenagem ácida de mina". PhD Program in Genetics, Universidade Federal de Minas Gerais, Vale S.A., Brasil, 2016.

João Ronaldo Vasconcelos Neto. “Metabolômica aplicada ao estudo da biodiversidade funcional em um fragmento de mata atlântica altamente impactada por metais pesados”. PhD Program in Biotechnology, Universidade Estadual de Feira de Santana, Brasil, 2015.

MSc Dissertation:

Assmaa El Khal. "Isolamento e Caracterização Genômica de Bacteriófagos com Potencial de Uso Terapêutico em Infecções Causadas por Enterobactérias". Master Program in Health Sciences, Brazil, 2014.

Luciana Cristina Andrade Costa Franco. "A Gestão de Resíduos das Indústrias Têxteis e os Princípios da Responsabilidade Social em Sergipe, 2008. 2007". Master Program in Health and Environment, Universidade Tiradentes, Brasil, 2007.

Yzila Liziane Farias Maia de Araújo. "Estudo da Atividade Antimicrobiana de Variedades de Própolis da Região da Foz do Rio São Francisco - Brasil. 2007". Master Program in Health and Environment, Universidade Tiradentes, Brasil, 2007.

Specialization dissertation:

Lorna Félix Falcão. Meio Ambiente e Desenvolvimento Humano na Região do Baixo São Francisco. 2004. (Especializacao em Engenharia Ambiental) - Universidade Tiradentes.

V - Undergraduate Students Supervision

Degree thesis (Tesis de titulación):

Francisca Tellería López. "Diseño de genosensor como plataforma para la detección electroquímica de hantavirus de interés sudamericano". 2020.

Josefa Quiroz Troncoso. “Caracterización físico-química y análisis cualitativo de propóleos mediante cromatografía en capa fina en la región del Maule”. Universidad Católica del Maule, 2018.

Nicolás Alegría Aravena, “Evaluación de diferentes técnicas de extracción de ADN para hongos halófilos, provenientes de las salinas de Cáhuil, Chile”. Universidad Católica del Maule, 2018.

Diego Moscoso Olivares, “Cuantificación de la actividad enzimática extracelular de procariotas halófilos aislados de una salina solar chilena”. Universidad Católica del Maule, 2018.

Assmaa El Khal. Análise metagenômica da água da barragem de rejeitos da mina de Sossego (Canaã dos Carajás - PA). Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013

Barbara Martins Xavier. Epidemiologia molecular de Klebsiella pneumoniae produtora de carbapenemase (KPC) no estado de Minas Gerais. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Centro Universitário UNA, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.

Jeane Rezende de Melo e Joane Farias Alves dos Santos. Avaliação de diferentes métodos de extração e purificação de DNA humano em solo. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biomédicas) - Universidade Tiradentes. 2008.

Diploma thesis (Trabajo de grado):

Nidia Torres Ponce. "Síntesis sustentable de nanopartículas de cobre utilizando bacterias antárticas". Universidad Católica del Maule, 2020.

Nicolás Valdivia - Trabajo de Grado (defensa realizada el 14/10/2020). Título: "Evaluación y caracterización de la producción de exopolisacáridos por microorganismos provenientes de ambientes termales". Universidad Católica del Maule, 2020.

Daniela Pedrero Fuentes, “Producción de películas poliméricas con ingredientes naturales para el desarrollo de envases activos”. Universidad Católica del Maule, 2020.

Nicole Stephanie Aceituno Serrano, “Evaluación de la actividad antimicrobiana de extractos de algas marinas contra hongos fitopatógenos”.Universidad Católica del Maule, 2018.

Nicolás Andrés Valdivia Vargas, “Caracterización de exopolisacáridos producidos por microorganismos termófilos”. Universidad Católica del Maule, 2018.

Sofía Patricia Araya Cruz, “Caracterización de biofilms producidos por microorganismos termófilos”. Universidad Católica del Maule, 2018.

Research internships:

Nicolás Andrés Valdivia Vargas, “Aislamiento e identificación de microorganismos de las fuentes geotermales del Complejo Volcánico Laguna del Maule”. Universidad Católica del Maule, 2018.

Diego Moscoso Olivares, “Uso de ureasas de procariotas halófilos aislados de una salina solar de chile en el tratamiento de aguas residuales”. Universidad Católica del Maule, 2018.

Viviani Mendes. Genômica para Soluções e Inovações Biotecnolõgicas. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Vale S.A..

Marília Lima da Conceição. Estudo do pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis, o agente etiológico da linfadenite caseosa. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.

Ticiane Henriques Santa Rita. Estudo da anemia falciforme e outras hemoglobinopatias na comunidade quilombola Patioba no município de Japaratuba ? Sergipe / Brasil. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Tiradentes, Universidade Tiradentes - Programa PROBIC.

Camilla Figueiredo Chianca. Estudo da produção de celulose por microrganismos isolados de Kombucha. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade Tiradentes, Universidade Tiradentes - Programa PROBIC.

Alexandre Cardoso Freitas. Avaliação da toxicidade aguda de corantes individuais e efluentes têxteis, antes e após tratamento, utilizando como organismos-teste Echinometra lucunter (ouriço-do-mar) e Artemia salina (microcrustáceo marinho). 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Tiradentes, Universidade
Tiradentes - Programa PROBIC.

Alyne Sobral da Silva. Avaliação do melhor método de extração para própolis verde e vermelha quanto à obtenção de atividades antibacteriana e antifúngica. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Universidade Tiradentes, Universidade Tiradentes - Programa PROBIC.

Janaína do Espírito Santo Silva. Prospecção e caracterização funcional de genes de interesse para o tratamento de efluentes têxteis. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Universidade Tiradentes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.

Rafael Figueiredo de Souza. Biodegradação de pesticidas por microrganismos isolados de solo. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia Ambiental) - Universidade Tiradentes.

Jeane Rezende de Melo. Monitoramento da biodegradação de biocidas de uso agrícola por bactérias isoladas de solo. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade Tiradentes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.

Garniey Silva Campos. Prospecção metagenômica de catalisadores biológicos para a degradação de corantes têxteis . 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Universidade Tiradentes, Universidade Tiradentes - Programa PROBIC.

Janaína do Espírito Santo Silva. Prospecção metagenômica de catalisadores biológicos para a degradação de corantes têxteis. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Universidade Tiradentes, Universidade Tiradentes - Programa PROBIC.

Lorna Falcão Félix. Degradação de hidrocarbonetos do petróleo por fungos isolados de solos. 2005. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia Ambiental) - Universidade Tiradentes, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Sergipe.

Otávio Augusto Carvalho de Oliveira Santos. Caracterização de microrganismos com potencial para uso em biorremediação de solos contaminados com hidrocarbonetos de petróleo. 2005. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade Tiradentes, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Sergipe.

Suiane Andrade Lima. Degradação de hidrocarbonetos do petróleo por microrganismos isolados de solos. 2005. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Tiradentes, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Sergipe.

Gustavo de Brito Cardoso. Seleção de Microrganismos de Solos Contaminados por Petróleo para Produção de Bioemulsificante. 2005. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia Ambiental) - Universidade Tiradentes, Universidade Tiradentes - Programa PROBIC.

Murilo Porto Brandão. Biodegradação de petróleo por bactérias e arqueas isoladas de solos. 2005. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia Ambiental) - Universidade Tiradentes, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Sergipe.

Felipe Alcântara Nunes. Biodegradação de pesticidas. 2004. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade Tiradentes.


Difusión y Transferencia


I - Organization of Scientific Events:

Simposio Chileno de Conservación y Valoración de los Recursos Genéticos Microbianos (2a edición), Chile, 2020.

Second International Symposyum on Extreme Environments and Extremophilic Organisms (ISE3O), Chile, 2019.

Simposio Chileno de Conservación y Valoración de los Recursos Genéticos Microbianos (1a edición), Chile, 2019.

Third International Workshop on Environmental Microbiology / Metagenomics Workshop. Brasil, 2014.

I Workshop "Bioinformática Next-Gen: Montagem e Anotaçao de Genomas Bacterianos Completos". Brasil, 2009.

II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental (WIMA). Brasil, 2008.

I Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental (WIMA). Brasil, 2005.

II - Invited Conferences:

Round table: "Mapa Microbiano de Chile". Congreso Digital de la Sociedad de Microbiología de Chile, Santiago, Chile, 2020.

Conference: "Bioinformatic challenges in metagenomic studies", XVII Coloquios de Microbiología de Valparaíso (https://www.gambio.cl/coloquios-2020/). Valparaiso, Chile, 2020.

Conference: “Bioinformática: una herramienta esencial en el estudio de la materia oscura microbiana" I Simposio Online de Bioinformática de la UCM. Talca, Chile, 2020.

Conference: "Study of the adaptive genetic variation in thermophilic archaea in the TSVZ". Metagenomics Forum, Alicante, España, 2020.

Conference: “Desafíos bioinformáticos en el estudio de microbiomas de desiertos”. Taller Internacional sobre Diversidad Microbiana de Ambientes Desérticos, Cuernavaca, México, 2019.

Conference: “Privacidad y confidencialidad de los datos genéticos”. VIII Jornadas De Bioética Universidad de Talca. Talca, Chile, 2019.

Conference: “Updates on the microbial ecology of extreme environments”. XLI Reunión Anual de la Sociedad Chilena de Microbiología (SOMICH). Puerto Varas, Chile, 2019.

Conference: “The hidden world of underexplored prokaryotes and their uncharacterized proteins”. International Conference in Bioinformatics, Simulations and Modeling. Talca, Chile, 2019.

Conference: "Acidibacillus ferrooxidans y su potencial aplicación en biominería". II Simposio Chileno en Biotecnología Microbiana y Bioingeniería. Antofagasta, Chile, 2018.

Conference: “Asociación entre taxonomía y función en microbiomas: desafíos y tendencias en bioinformática”. II Simposio Internacional de Bioinformática Integrativa (SIBI 2018), Santiago, Chile, 2018.

Conference: “Metagenomics and single-cell genomics: dissecting the microbiome of an acid mine drainage in Brazil”. XXIV Congreso Latinoamericano de Microbiología (ALAM 2018), Santiago, Chile, 2018.

Conference: “Metagenómica aplicada a la extracción mineral: un estudio de caso de la minería de cobre”. IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental (IV CAMAyA), Mar del Plata, Argentina, 2018.

Conference: “Trends in Microbiome Research”. Congreso Annual de la Asociación Latinoamericana de Genética (ALAG), Montevideo, Uruguay, 2016.

Conference: “Metagenomics for Biotechnology in the mining industry”. SIMB Annual Meeting, Saint Louis, United States, 2014.

Conference: “Aquatic Microbial Ecology and Metagenomics as a tool for the prospection of genes with biotechnological interest”, Medellín, Colombia, 2010.

III - Presentation in Scientific Meetings

Poster: "Caracterización de rizobacterias aisladas desde el Salar de Huasco" (Región de Taparacá, Chile), un ambiente poli-extremo en el altiplano chileno. In: ISME LA - International Symposium on Microbial Ecology - Latin America, Valparaiso, 2019.

Poster: "Insights into the population history of free-living bacteria as counted by their CRISPR inventory". ISME 16 - 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME). Montreal, Canada, 2016.

Poster: "Functional diversity in a copper acid mine drainage: metagenomics and single cell analysis". ISME 16 - 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME). Montreal, Canada, 2016.

Poster: "Effect of phosphorus fertilization on bacterial microbiome in microsites Zea mays rhizosphere and endosphere". In: XXIII Congreso Latinoamericano de Microbiologia, Rosario, Argentina, 2016.

Poster: "Comunidade bacteriana e fúngica da rizosfera de milho cultivado sob diferentes fontes de fosfato utilizando sequenciamento de nova geração". In: XXXI Congresso nacional de Milho e Sorgo. Milho e sorgo: Inovações mercados e segurança alimentar, 2016, Bento Gonçalves, RS. Anais do XXXI Congresso nacional de Milho e Sorgo. Milho e sorgo: Inovações mercados e segurança alimentar, 2016.

Poster: "Microbial diversity in a copper acid mine drainage: metagenomics and single cell analysis". In: Congreso Latinoamericano de Genética, 2016, Montevidéu. Journal of Basic and Applied Genetics. Buenos Aires: Sociedad Argentina de Genética, 2016.

Poster: "O crescimento e produtividade de milho é dependente da microbiota associada às plantas e da fonte de fosfato usada no cultivo". In: II Simposio de microbiologia da UFMG, Belo Horizonte, Brasil, 2016.

Poster: "Rock phosphate solubilization by rhizobacteria and endophytic associated with maize (Zea mays L.)". In: Rhizosphere 4, 2015, Maastricht. Nutrient Acquisition, 2015.

Poster: "Bacterias endofíticas de milho (Zea mays) solubilizadoras de fosfato de Araxá". In: Semana do Conhecimento UFMG- XXIV Semana de Iniciação Científica / PRPq, Belo Horizonte, Brasil, 2015.

Attendance: Single Cell Genomics Workshop. East Boothbay, Estados Unidos, 2015.

Poster: "Single-cell amplified genomes from acid mine drainage in the Brazilian Amazon In: 61 Congresso Brasileiro de Genética. Águas de Lindóia, Brasil, 2015.

Poster: "Study of microbial community from a mining environment" In: 28º Congresso Brasileiro de Microbiologia, Florianópolis, Brasil, 2015.

Poster: "Solubilização de fosfato de rocha por bacterias rizosféricas associadas ao milho (Zea mays)". In: Simpósio de Microbiologia da UFMG I, 2014, Belo Horizonte, Brasil, 2014.

Oral presentation: ISME 15 - 15th International Symposium on Microbial Ecology. Metagenomics for Biotechnology in the Mining Industry. Seoul, South Korea, 2014.

Poster: "Taxonomic and functional diversity of microbial community from a mining environment" In: ISCB-LA/ X-Meeting, Belo Horizonte, 2014.

Poster: "Bacterias endofíticas de milho (zea mays) solubilizadoras de fosfato de Araxá". In: Semana do Conhecimento UFMG- XXIV Semana de Iniciação Científica / PRPq, 2015, Belo Horizonte. Semana do Conhecimento UFMG- XXIV Semana de Iniciação Científica / PRPq, 2015.

Poster: "Bioeletrodo para detecção do material genômico da Neisseria meningitidis". In: XXVIII Encontro Regional da Sociedade Brasileira de Química, 2014, Poços de Caldas. Anais do XXVIII Encontro Regional da Sociedade Brasileira de Química, 2014.

Poster: "Electroanalytical efficiency of gold nanoparticles onto poly(4-aminophenol) matrix for meningitis diagnosis". In: XII Encontro da Sociedade Brasileira de Pesquisa em Materiais, 2013, Campos do Jordão. Anais do XII Encontro da Sociedade Brasileira de Pesquisa em Materiais, 2013.

Poster: "Bioeletrodo eletroquímico para detecção indireta de meningite
usando poli (4-aminofenol) como matriz". In: Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, Águas de Lindóia, Brasil, 2012.

Poster: "Specificity study of the bioelectrode for meningitis detection". In: 5th International Symposium of Post Graduation and Research, 2012, Ribeirão Preto.

Poster: "Bioeletrodo para detecção da meningite usando poli(4-aminofenol) como matriz". In: xx Congresso da Sociedade Iberoamericana de Eletroquímica, Fortaleza, Brasil, 2012.

Poster: "Electrogeneration of polymeric films derived from 3-aminothiophenol for immobilization of DNA fragments of meningitis". In: Encontro Anual da Sociedade de Pesquisa em Materiais (SBPMat), Gramado, Brasil, 2011.

Poster: "Aplicaçao da Tecnologia de Cromatografia Desnaturante de Alto Desempenho (DHPLC) no Conhecimento da Diversidade Bacteriana Endofítica Durante o Processo Inicial de Fermentaçao da Mandioca (Manihot sp.)". In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, Porto de Galinhas, Brasil, 2009.

Poster: "Avaliação da Atividade Antimicrobiana de Própolis Vermelha Extraida por Diferentes Métodos". In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, Porto de Galinhas, Brasil, 2009.

Poster: "Avaliação da Biodegradação do Corante Têxtil Sintético Preto de Diresul". In: XVII Simpósio Nacional de Bioprocessos, Natal, Brasil, 2009.

Poster: "Co-ocorrência, identificação morfológica e molecular de espécies de ostras nativas do gênero Crassostrea (Mollusca: Bivalvia) no estuário do rio Vaza Barris (SE)". In: 55º Congresso Brasileiro de Genética, Águas de Lindóia, Brasil, 2009.

Poster: "Estudo da produção de celulose por microrganismos isolados de kombucha". In: Semana de Pesquisa, Aracaju, Brasil, 2009.

Poster: "Identificação, caracterização e comparação in silico das Ilhas de Patogenicidade (PAIs) de Corynebacterium pseudotuberculosis". In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, Porto de Galinhas, Brasil, 2009.

Poster: "In silico analysis suggests a putative arsC homolog protein in Corynebacterium pseudotuberculosis". In: 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, Angra dos Reis, Brasil, 2009.

Poster: "Isolamento de Microrganismos com Potencial para Produção de Biosurfactante". In: XVII Simpósio Nacional de Bioprocessos, Natal, Brasil, 2009.

Poster: "Seleção de Microrganismos Degradadores do Corante Têxtil Verde de Indanthren." In: XVII Simpósio Nacional de Bioprocessos, Natal, Brasil, 2009.

Poster: "Sequenciamento dos genomas de linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis utilizando a plataforma SOLiD". In: 25º Congresso Brasileiro de Microbiologia, Porto de Galinhas, Brasil, 2009.

Poster: "Aplicação de métodos computacionais na exploração da diversidade e estrutura de azoredutases flavina-dependentes em procariotos". In: Congresso Brasileiro de Engenharia Química, Recife, Brasil, 2008.

Poster: "Fontes Polínicas Utilizadas por Apis Mellifera L. na Região da Foz do Rio São Francisco - SE". In: 17º Congresso Brasileiro de Apicultura, Belo Horizonte, Brasil, 2008.

Poster: "Identificação Palinológica em Amostras de Própolis do Município Litorâneo de Brejo Grande - SE". In: 17º Congresso Brasileiro de Apicultura, 2008, Belo Horizonte, Brasil, 2008.

Oral presentation: "Produção de Lipase através de Microrganismos Isolados de Solos com Histórico de Contato com Petróleo". In: II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental (WIMA 2008), Aracaju, Brasil, 2008.

Poster: "Análise do teor de flavonóides e da atividade antimicrobiana em diferentes métodos de extração de uma variedade de própolis da Bahia". In: 4º Seminário de Própolis do Nordeste, Itabuna, Brasil, 2007.

Poster: "Biosurtfactant production by bacterium strain isolated from petroleum contaminated soil". In: 29th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, 2007, Denver, EUA.

Oral presentation: "Biodegradation of Aromatic Compounds and PAHsby Halophilic Archaea". In: Ninth International In Situ and On-Site Bioremediation Symposium, Baltimore, EUA, 2007.

Poster: "Influence of Temperature on Microbial Growth during Urban Biowaste Composting In: 24º Congresso Brasileiro de Microbiologia, Brasília, DF, Brasil, 2007.

Poster: "Molecular diversity and ecological significance of prokaryotic flavin-dependent azoreductases". In: 24º Congresso Brasileiro de Microbiologia, Brasília, Brasil, 2007.

Oral presentation: "Enhanced TPH biodegradation by bacterial strains isolated from coastal environments In: Simpósio Nacional de Bioprocessos, Curitiba, Brasil, 2007.

Oral presentation: "Solar Water Disinfection in Northeast Brazil: kinetics of the microbiological process and the study for the development of a pilot". In: Conferencia Internacional de Cocina Solar y Procesado de Alimentos, 2006, Granada, Espanha, 2006.

Oral presentation: "Biodegradation of Aromatic Compounds by Halophilic Archaea In: Remediation of Chlorinated and Recalcitrant Compounds", Fifth International Conference, Monterey, CA (USA), 2005.

Oral presentation: "Aromatic acid metabolism by haloarchaea isolated from solar salterns in Cahuil (Chile)". In: 12th International Biotechnology Symposium and Exhibition, Santiago, Chile, 2004.

Oral presentation: "Isolation and characterization of halophilic archaea able to grow in aromatic compounds". In: Fifth Latin American Biodegradation and Biodeterioration Symposium (LABS 5), Campeche, México, 2004.

IV - Patent Granted

Electrochemical genosensor for the diagnosis of meningococcal meningitis (#BR10201303131). Fecha de Depósito: 05/12/2013. Fecha de Publicación: 10/11/2015. Clasificación IntCL: G01N 33/50 ? G01N 27/30 ? C12R 1/36 ? C12N 15/11

V - Research visits

Evolutionary Genomics Group. Universidad Miguel Hernández, Spain, 2013.


Premios y Distinciones

  •   Beca de Productividad en Desarrollo Tecnológico e Innovación

    Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq)

    Brasil, 2009

    Bioinformática pós-genômica e inovações para a indústria farmacêutica e de biocombustíveis

  •   Beca de Pasantía Doctoral en el Extranjero

    Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq)

    Brasil, 2000

    Pasantía Doctoral. University of Pennsylvania, USA.

  •   Beca de Postdoctorado en el Extranjero

    Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq)

    Brasil, 2006

    Beca de Postdoctorado en el Extranjero. Universidad Miguel Hernández, España.

  •   Beca Doctoral

    Coordinación de la formación del personal de nivel superior (CAPES)

    Chile, 2000

    Beca de doctorado nacional. Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Brasil.

  •   Beca de Magíster

    Coordinación de la formación del personal de nivel superior (CAPES)

    Chile, 1997

    Beca de Magíster. Universidad de Sao Paulo, Brasil.

  •   Beca de Iniciación Científica

    Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq)

    Chile, 1994

    Beca de pregrado - modalidad Iniciación Científica


 

Article (41)

Editorial: Microbial communities from geothermal fields: recent advances on characterization, interaction with the environment, and potential applications in biotechnology
Exploring the mycobiota of bromeliads phytotelmata in Brazilian Campos Rupestres
Antimicrobial Properties of Chilean Native Plants: Future Aspects in Their Application in the Food Industry
Characterization of microbial communities from gut microbiota of hypercholesterolemic and control subjects
Genomic analysis of sewage from 101 countries reveals global landscape of antimicrobial resistance
Genomic and Phenotypic Insights Into the Potential of Rock Phosphate Solubilizing Bacteria to Promote Millet Growth in vivo
Setting a baseline for global urban virome surveillance in sewage
Cellulases Production by a Trichoderma sp. Using Food Manufacturing Wastes
Global monitoring of antimicrobial resistance based on metagenomics analyses of urban sewage
Molecular and Genomic Characterization of PFAB2: A Non-virulent Bacillus anthracis Strain Isolated from an Indian Hot Spring
A new genosensor for meningococcal meningitis diagnosis using biological samples
A novel polymer-based genosensor for the detection and quantification of <i>Streptococcus pneumoniae</i> in genomic DNA sample
Immunosensor assembled on polymeric nanostructures for clinical diagnosis of C-reactive protein
Long-term rock phosphate fertilization impacts the microbial communities of maize rhizosphere
Long-Term Rock Phosphate Fertilization Impacts the Microbial Communities of Maize Rhizosphere
Single cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp. in acid mine drainage
Single-cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp in acid mine drainage
Single-cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp in acid mine drainage
Using next-generation sequencing (NGS) to uncover diversity of wood-decaying fungi in neotropical atlantic forests.
Complete mitochondrial genome sequence of Melipona scutellaris, a Brazilian stingless bee.
Draft Genome Sequence of a Novel Acidophilic Iron-Oxidizing Firmicutes Species, “ Acidibacillus ferrooxidans ” (SLC66 T )
Draft Genome Sequence of a Novel Acidophilic Iron-Oxidizing Firmicutes Species, "Acidibacillus ferrooxidans" (SLC66T).
Draft Genome Sequence of Hydrotalea flava Strain CCUG 51397T.
ZIKV - CDB=> A Collaborative Database to Guide Research Linking SncRNAs and ZIKA Virus Disease Symptoms.
Antioxidant activity and phenolic content of the red propolis from the state of Sergipe, Brazil.
Chemical markers and antifungal activity of red propolis from Sergipe, Brazil.
Electropolymerization of hydroxyphenylacetic acid isomers and the development of a bioelectrode for the diagnosis of bacterial meningitis
Taxonomic and functional diversity of microbial community from a mining environment
Preliminary characterization of mitochondrial genome of Melipona scutellaris, a Brazilian stingless bee.
Use of PCR-DHPLC with fluorescence detection for the characterization of the bacterial diversity during cassava (Manihot esculenta Crantz) fermentation.
Assessment of Fungal Diversity in the Environment using Metagenomics=> a Decade in Review
Biodegradation of Aromatic Compounds by a Halophilic Archaeon Isolated from the Dead Sea
Lipase production by bacterial isolates from petroleum contaminated soil
Larvicidal activity of Cladonia substellata extract and usnic acid against Aedes aegypti and Artemia salina
Solar Water Disinfection in Northeast Brasil=> kinetics of the process and the study for the development of a pilot plant.
Genomic plasticity in prokaryotes=> the case of the square haloarchaeon.
Isolation and characterization of halophilic archaea able to grow in aromatic compounds
Effect of undecanoic acid on production of esterases and lipases by Aspergillus nidulans
Undecanoic acid resistance in filamentous fungi=> identification and linkage mapping of the Aspergillus nidulans udaA gene.
The Aspergillus nidulans phsB4 mutation alters colonial growth and development of the mould at acidic pH
Identification and linkage mapping of the phsA gene of Aspergillus nidulans, where mutation affects growth and pigmentation of colonies in a temperature- and pH-dependent way

BookSection (3)

Exopolysaccharides and Biofilms in Mitigating Salinity Stress: The Biotechnological Potential of Halophilic and Soil-Inhabiting PGPR Microorganisms.
Fungal diversity in lignocellulosic woody plant residues from a neotropical rainforest fragment: A metagenomics approach
Biodegradation of aromatic compounds and PAHs by halophilic archaea

ConferencePaper (2)

Metagenomic binning based on unsupervised extreme learning machine
Assessment of fungal diversity in decaying wood from a neotropical rainforest

Patent (1)

Electrochemical genosensor for the diagnosis of meningococcal meningitis (#BR10201303131)

Proyecto (15)

Desarrollo Tecnológico de un Hidrogel Antimicrobiano Aplicable a Envases de Frutas de Exportación
Hydrothermal environments: a window to understand microbial life during the early Earth
Study of the adaptive genetic variation in thermophilic archaea from a micro- and macro-evolutionary perspective
Innovación en Envases Activos para Frutas de Exportación
Microbial Complexity gradients in polyextreme environments
Principles and Trends in Genomics and Computational Biology
Diversidade e características funcionais de comunidades endofiticas de milho avaliadas por análise metagenômica
Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental (WIMA)
Desenvolvimento de Biossensores para Aplicações Diagnósticas em Infarto Agudo do Miocárdio e Meningite
Vale-Fiocruz Genomics Center
Bioinformática Pós-Genômica e Inovações para a Indústria Farmacêutica e de Alimentos
Caracterização de diferentes variedades de Própolis na Região do Baixo São Francisco
Prospección de genes con potencial biotecnológico
Seleção de microrganismos para despoluição de áreas contaminadas com pesticidas
II Workshop Internacional sobre Microbiologia Ambiental (II WIMA)

Review (1)

Rising awareness to improve conservation of microorganisms in terrestrial ecosystems: advances and future directions in soil microbial diversity from Chile and the Antarctic Peninsula
29
Sara Cuadros

Profesor Titular

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

2
Alex Echeverría

Académico Adjunto

Centro de Investigación en Estudios Avanzados del Maule (CIEAM)

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

1
Aiko Adell

Profesor Asociado

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Carolina Quinteros

Docente

Escuela de Trabajo Social

Universidad Andrés Bello

Viña del Mar, Chile

1
Alexandra Stoll

Lead Researcher

CENTRO DE ESTUDIOS AVANZADOS EN ZONAS ARIDAS - CEAZA

La Serena, Chile

1
Claudia Rojas

Associate professor

Instituto de Ciencias Agroalimentarias, Animales y Amientalesas y Veterinarias

Universidad de O'Higgins

San Fernando, Chile

1
MARIA MARTINEZ

JEFE SECCION

SALUD AMBIENTAL

INSTITUTO DE SALUD PUBLICA

SANTIAGO, Chile

1
Esteban Paredes

Encargado de Laboratorio

Salud Ambiental

Instituto Salud Pública

Santiago, Chile

1
Nicolás Saavedra

Profesor Asociado

Departamento de Ciencias Básicas

Universidad de La Frontera

Temuco, Chile

1
Gabriel Rojas

Academico

Universidad Autónoma de Chile

Talca, Chile

1
Vinicius Ramos Henriques

Associate Professor

Advanced Center for Chronic Diseases - ACCDiS

Univesidad de Chile

Santiago, Chile

1
CRISTIAN ATALA

Profesor adjunto

Instituto de Biología

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Curauma, Chile

1
Aparna Banerjee

Profesor Asociado

Instituto de Ciencias Aplicadas

Universidad Autónoma de Chile

Talca, Chile

1
Rodrigo Morales

Investigador

Ingenieria en Biotecnologia

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

1
Felipe Gordillo

UNIVERSIDAD CATÒLICA DEL MAULE

Talca, Chile

1
LEA CABROL

Investigadora adjunta

Instituto Milenio BASE (Biodiversidad de Ecosistemas Antarcticos y Subantarcticos)

Santiago, Chile

1
Julieta Orlando

Associate Professor

Ecological Sciences

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Ivan Nancucheo

Profesor Titular

Facultad de Ingeniería, Arquitectura y Diseño

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile