Marea roja. Distribución y abundancia de quiste de dinoflagelados, con énfasis en Alexandrium catenella. Modelos hidrodinámicos. Oceanografía aplicada a la acuicultura.

Tesis y/o Seminario de Título.
1987-88 Cuantificación de la Materia Orgánica Disuelta Utilizable (UDOM) y su relación con la biomasa bacteriana. Tesis Licenciatura en Ciencias Biológica. Pontificia Universidad Católica de Chile. Estudiante Sr. A. Daroch V.

1989-90 Morfología y tasas de pastoreo de microflagelados. Tesis Licenciatura en Ciencias Biológicas. Pontificia Universidad Católica de Chile. Estudiante Sra. A. Acevedo F.

1989-90 Producción secundaria bacteriana y sus relaciones con los aminoácidos, clorofila-a, en la Bahía de Concepción, Chile. Tesis Licenciatura en Ciencias Biológicas. Pontificia Universidad Católica de Chile. Estudiante Sr. A. Pacheco T.

1995-96 Bacterioplancton oceánico y costero en el Norte de Chile. Tesis Licenciatura en Ciencias Biológicas. Pontificia Universidad Católica de Chile. Estudiante Srta. R. Cid S.

1998 Efectos de la predación de flagelados planctónicos sobre el bacterioplancton. Tesis Biólogo Marino. Universidad de Concepción. Estudiante Sr. L.A. Cuevas L.

1999 Utilización de bacterias como recurso alimenticio de Mytilus chilensis (Hupe, 1857) en Centros de Cultivo de Chiloé, X región. Tesis Biólogo Marino. Universidad de Concepción. Estudiante Srta. Fabiola Cid W.

1999 Producción primaria en el Canal Yal, Chiloé. Tesis Biólogo Marino. Universidad de Concepción. Estudiante Srta. Nuria González

2000 Estimación de la variabilidad espacio-temporal del impacto potencial de la herbivoría por el zooplancton del Canal Yal, Chiloé. Tesis Biólogo Marino. Universidad de Concepción. Estudiante Sr. Cristian Agurto.

2004 Registro histórico reciente de quistes de dinoflagelados productores de floraciones algales nocivas (FAN) en sedimentos marinos del sur de Chile (Décima región). Biólogo Marino. Universidad de Concepción. Estudiante Sr. Pablo Salgado G.

2004 Comparación espacial y temporal de nutrientes orgánicos disueltos en tres localidades del mar interior de Chiloé, X Región. Tesis Biólogo Marino. Universidad de Concepción. Estudiante Srta. Fabiola Lara
2005 La trazabilidad en la industria pesquera: Estrategias de gestión. Seminario de Título, Ingeniería de Ejecución en gestión Pesquera. Universidad de Concepción. Estudiantes: Sras. Sandra Cané G., Susana Pincheira Y. y M. Eugenia Raurich R.

Tesis de Magister
1995-96 Efecto de la predación en la estructura de tallas y crecimiento bacteriano. Tesis Magíster en Ciencias, mención Oceanografía, Universidad de Concepción. Estudiante Sr. Gonzalo Cid B.

2008-09 Variabilidad espacio-temporal de ensambles de hipnoquistes de dinoflagelados productores de eventos FANs en sedimentos costeros recientes del sur de Chile (región de Los Lagos) durante el último siglo.Tesis Magíster en Ciencias, mención Oceanografía, Universidad de Concepción. Estudiante Sr. Pablo Salgado G.

01.- Chong, J., E. Tarifeño, J. Ledermann y V.A. Troncoso. Caracterización puntual de los parámetros abióticos en las pesquerías del jurel (Trachurus murphyi) y sardina (Sardinops sagax) en el área de Talcahuano. I Jornadas Ciencias del Mar. Viña del Mar, 1981.
02.- Tarifeño, E., E. Toledo, V.A. Troncoso y M. Rojas. Fisiología ecológica de la almeja Mulinia edulis (Bivalvia: Mactracidae). I Jornadas Ciencias del Mar. Viña del mar, 1981.
03.- Troncoso, V.A. y G. Toledo. Estudio de la influencia de los sedimentos sobre el comportamiento enterrador de la macha Mesodesma donacium (Lamarck, 1818) (Bivalvia: Mesodesmatidae). I Jornadas Ciencias del Mar. Viña del Mar, 1981.
04.- Troncoso, V.A. y E. Tarifeño. Influencia de la granulometría de los sedimentos sobre el comportamiento enterrador de Mesodesma donacium (Lamarck, 1818) (Bivalvia: Mesodesmatidae). II Jornadas Ciencias del Mar. Concepción, 1982.
05.- Arrizaga, A., C. Oyarzún, V.A. Troncoso, S. Fernández, V. Soto y E. Avello. Antecedentes biológicos y pesqueros (preliminares) de Dissostichus eleginoides (Smith, 1880) (Perciformes: Notothenidae), en el litoral de la Octava Región. IV Jornadas Ciencias del Mar. Valparaíso, 1984.
06.- Chong, J., J. Ledermann y V.A. Troncoso. Condiciones hidrográficas estivales en la zona pesquera del Golfo de Arauco y su relación con las capturas de jurel. V Jornadas Ciencias del Mar. Coquimbo, 1985.
07.- Troncoso, V.A. y L. Castro. Distribución vertical del zooplancton durante enero de 1985 en el Golfo de Arauco, Chile. V Jornadas Ciencias del Mar. Coquimbo, 1985.
08.- Zuniga, M., V.A. Troncoso, R. Becerra y J. Cordovez. Efectos del cobre en Aulacomya ater (Molina, 1782) (Mortalidad y Sobrevivencia). VI Jornadas Ciencias del Mar. Osorno, 1986.
09.- Bernal, P., L. Castro y V.A. Troncoso. Variabilidad diurno-nocturno en las distribuciones verticales de copépodos en el área de surgencia del Golfo de Arauco. Enero 1985. VI Jornadas Ciencias del Mar. Osorno, 1986.
10.- Bernal, P., M. George-Nacimiento, L. Vergara y V.A. Troncoso. Patrones de variación espacial y temporal de la abundancia en una taxocenosis de copépodos. VI Jornadas Ciencias del Mar. Osorno, 1986.
11.- Ahumada, R., J. Morillas, V.A. Troncoso, A. Rudolph y T. Contre¬ras. Coloración roja producida por bacterias: Marisma Rocuant, Talcahuano. VIII Jornadas Ciencias del Mar. Thno., 1988.
12.- Pantoja, S., V.A. Troncoso, J.L. Iriarte, H. González y V. Martínez. Relación entre la distribución vertical de aminoácidos disueltos, clorofila-a y abundancia zooplanctónica. VIII Jornadas Ciencias del Mar. Thno., 1988.
13.- Daroch, A., V.A. Troncoso y P. Bernal. Cuantificación de la materia orgánica disuelta utilizable (UDOM) y su relación con la producción bacteriana y biomasa fitoplanctónica y bacteriana. VIII Jornadas Ciencias del Mar. Thno., 1988.
14.- Osses, J. y V.A. Troncoso. Variables oceanográficas y distribución superficial de clorofila-a en la Zona Norte de Chile en el año 1988. X Jornadas Ciencias del Mar. Santiago, 1990.
15.- Troncoso, V.A. Biomasa y producción bacteriana. Coloquio: Estudio de flujos biogeoquímicos globales en el Pacífico Sur-oriental. Componente JGOFS-Chile. A. Antezana, V. Dellarossa, V. Montecinos, J. Ruttland, S. Salinas, V.A. Troncoso. XII Jornadas Ciencias del Mar. Santiago, 1992.
16.- Troncoso, V.A. Estacionalidad de la producción bacteriana, frente a Coquimbo, Chile. XIII Jornadas de Ciencias del Mar. Viña del Mar, 1993.
17.- Pacheco, A. y V.A. Troncoso. Distribución del tamaño celular del bacterioplancton, abundancia y productividad en la Bahía de Concepción. La importancia de la disponibilidad de nutrientes y la importancia de los bacterióvoros. XIV Jornadas de Ciencias del Mar. Puerto Montt, 1994.
18.- Troncoso, V.A., G. Daneri y S. Spitzi. Primeras mediciones de carbono orgánico disuelto en el Pacífico Sur oriental. XV Jornadas de Ciencias del Mar. Coquimbo, 1995.
19.- Troncoso, V.A.. Producción bacteriana en los 33°S. XV Congreso de Ciencias del Mar. Coquimbo, 1995
20.- Daneri, G., D. Hebbeln, V. Montecino, C. Morales, R. Quiñones y V.A. Troncoso. Production and utilization carbon rates in Ocemos (30°S, 73°15’W) and Cosmo (30°15’S, 72°01’W) stations off Coquimbo, measurement during JGOFS IX, X, and XI cruises (1994-1995). XVI. Congreso de Ciencias del Mar. Concepción, 1996.
21.- Troncoso, V.A. y P. Escares. Abundancia y producción del bacterioplancton frente a Antofagasta, durante enero de 1997. XVII Congreso de Ciencias del Mar. Santiago, 1997, Resúmenes pág. 153
22.- Troncoso, V.A. y G. Daneri. Producción y abundancia bacteriana frente a Antofagasta, Chile (23°S) durante el verano e invierno de 1997. XVIII Congreso de Ciencias del Mar. Iquique 1998, Resúmenes pág. 128
23.- Daneri, G.; V.A. Troncoso, A. Spitzy, B. Jacob y P. Montero. Mediciones de carbono orgánico disuelto y producción bacteriana en los ecosistemas de surgencia de Coquimbo y Antofagasta. XVIII Congreso de Ciencias del Mar. Iquique 1998, Addendum. pág. 1.
24.- Cid, F.; V.A. Troncoso y M.A. Salamanca. Utilización de las bacterias como recurso alimenticio de Mytilus chilensis en Centros de Cultivos de Chiloé, X región. XX Congreso de Ciencias del Mar. Concepción 2000. Resúmenes pág. 96
25.- Carro, M.; M.A. Salamanca, V.A. Troncoso, E. Bustos y E. Pacheco. Modelación del sistema de circulación en canales interiores de la Isla de Chiloé. XX Congreso de Ciencias del Mar. Concepción 2000. Resúmenes pág.
26.- Troncoso, V.A.; G. Daneri, L. Cuevas y B. Jacob. Producción y biomasa bacteriana en el Sistema de Corrientes de Humboldt (SCH) de Chile. XX Congreso de Ciencias del Mar. Concepción 2000. Resúmenes pág. 201
27.- Troncoso, V. A., M.A. Salamaca, A. Camaño y N. González. Fraccionamiento del cobre por el fitoplancton. XX Congreso de Ciencias del Mar. Concepción 2000. Resúmenes Addendum. pág. 1.
28.- Agurto, C; V.A. Troncoso y M. A. Salamanca. Impacto de la fitofágia del zooplancton quitinoso en el Canal de Yal, Chiloé. XXI Congreso de Ciencias del Mar. Viña del Mar 2001. Resúmenes. pág. 3.
29.- Cuevas, A.; G. Daneri, B. Jacob y V.A. Troncoso. Control del bacterioplancton en la zona de surgencia de Chile central. XXI Congreso de Ciencias del Mar. Viña del Mar 2001. Resúmenes pág. 26.
30.- González, N.; V.A. Troncoso y M. A. Salamanca. Relaciones fotosíntesis-luz (curvas P vs I) en el Canal de Yal, Chiloé (Chile). XXI Congreso de Ciencias del Mar. Viña del Mar 2001. Resúmenes pág. 116.
31.- Agurto, C; V.A. Troncoso y M. A. Salamanca. Variabilidad espacio-temporal del impacto potencial de la herbivoría por el zooplancton quitinoso en el Canal de Yal, Chiloé. Chile. IX Congreso Latino-Americano de Ciencias del Mar, COLACMAR. I. San Andrés, Colombia. (2001)
32.- Agurto, C; V.A. Troncoso y M. A. Salamanca. Estimación de tasas de evacuación en organismos holo- y meroplanctónicos. IX Congreso Latino-Americano de Ciencias del Mar, COLACMAR. I. San Andrés, Colombia. (2001)
33.- Troncoso, V.A.,; M.A. Salamanca, E. Bustos. Capacidad de carga en un centro de cultivo de bivalvos. XVII Congreso Chileno de Ingeniería Sanitaria y Ambiental (AIDIS). Puerto Varas, 14-16 Noviembre 2007.
34.- Troncoso, V.A.; M.A. Salamanca, E. Bustos. Geocronología reciente de quistes de algas tóxicas en Chiloé. XVII Congreso Chileno de Ingeniería Sanitaria y Ambiental (AIDIS). Puerto Varas, 14-16 Noviembre 2007.
35.- Salamanca, M.A.; V.A. Troncoso, E. Bustos y P. Campos. Soluciones técnicas para el manejo de residuos provenientes de la salmonicultura. XVII Congreso Chileno de Ingeniería Sanitaria y Ambiental (AIDIS). Puerto Varas, 14-16 Noviembre 2007.
36.- Salamanca, M.A.; V.A. Troncoso, E. Bustos y P. Campos. Desarrollo de un sistema de medición in situ de variables críticas del RAMA. XVII Congreso Chileno de Ingeniería Sanitaria y Ambiental (AIDIS). Puerto Varas, 14-16 Noviembre 2007.